Structural Basis for 3-Amino-3-carboxypropyl Transfer in Nocardicin Biosynthesis
Rattachement africain : cn, jp, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
S -Adenosyl- l -methionine (SAM) is well-known as a methyl donor for methyltransferases but also functions as a 3-amino-3-carboxypropyl (3-ACP) donor for 3-ACP transferases. NAT is a 3-ACP transferase which accepts β-lactam antibiotic nocardicin G ( 1 ) and SAM to produce isonocardicin C. Due to the lack of structural information about this enzyme, its reaction mechanism has not been fully identified. In this study, we report two X-ray crystal structures of NAT, including its apo and complex structure with 1 and SAH. Examination of them identified the structural basis for substrate recognition. Comprehensive approach integrating site-directed mutagenesis, thermal shift assay, MD simulation, and QM/MM calculation revealed that the Cα-amino group of SAM functions as a Brønsted base to enhance the nucleophilicity of the C6′-OH of 1, with the assistance of E143, thereby facilitating S N 2 attack on the Cγ of SAM. This study presents structural and computational analysis leading to more precise understanding of 3-ACP transfer.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Structural Basis for 3-Amino-3-carboxypropyl Transfer in Nocardicin Biosynthesis
- Date Crossref
- 08/09/2025
- Éditeur
- American Chemical Society (ACS)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Shanghai Jiao Tong University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
The University of Tokyo pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Kumamoto University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
RIKEN Center for Sustainable Resource Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Japan Science and Technology Agency FOREST pays non établi dans la noticeOrganisme public
-
Johns Hopkins University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Graduate School of Pharmaceutical Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
and School of Life Sciences and Biotechnology State Key Laboratory of Microbial Metabolism pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Graduate School of Agricultural and Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Collaborative Research Institute for Innovative Microbiology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Department of Chemistry pays non établi dans la noticeInstitution
Shanghai Jiao Tong University, The University of Tokyo et Kumamoto University, avec 8 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.