Nanopolysaccharide Builder: A User-Friendly Tool for Atomistic Models of Polysaccharide-Based Nanostructures
Rattachement africain : ca, Afrique du Sud, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
, a user-friendly software tool designed to construct polysaccharide nanostructures─mainly those based on cellulose, chitin, and chitosan─using experimental data or user-defined parameters. NPB enables the generation of cellulose and chitin allomorphs with customizable biochemical topologies and also facilitates the construction of large bundles that replicate nanostructures found in biological support systems, including plant cell walls and arthropod cuticles. The software outputs atomic Cartesian coordinates in Protein Data Bank (PDB) format and also provides atom connectivity files in PSF and PARM formats, ensuring seamless integration with major molecular dynamics (MD) engines such as NAMD, CHARMM, GROMACS, AMBER, OpenMM, and LAMMPS. Built on an interactive visualization framework, NPB features a graphical user interface (GUI) and supports both macOS and Linux operating systems. By enabling detailed atomic-scale studies of polysaccharide evolution in extracellular matrices and cell walls of algae, bacteria, fungi, and plants, NPB is poised to advance AI-guided research in sustainable chemical development and biomass utilization.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Nanopolysaccharide Builder: A User-Friendly Tool for Atomistic Models of Polysaccharide-Based Nanostructures
- Date Crossref
- 04/09/2025
- Éditeur
- American Chemical Society (ACS)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of British Columbia Bioproduct Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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National Bioproducts Institute (South Africa) Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Entreprise
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Oak Ridge National Laboratory Biosciences Division pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Tennessee at Knoxville Department of Biochemistry and Cellular and Molecular Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Bioproduct Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Biosciences Division pays non établi dans la noticeInstitution
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UT/ORNL Center for Molecular Biophysics pays non établi dans la noticeInstitution
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Department of Chemistry pays non établi dans la noticeInstitution
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Department of Biochemistry and Cellular and Molecular Biology pays non établi dans la noticeInstitution
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Department of Wood Science pays non établi dans la noticeInstitution
Bioproduct Institute — University of British Columbia, National Bioproducts Institute (South Africa) (Afrique du Sud) et Biosciences Division — Oak Ridge National Laboratory, avec 7 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.