Advancing bioinformatics capacity through Nextflow and nf-core: lessons from an early-to mid-career researchers–focused program at The Kids Research Institute Australia
Rattachement africain : au, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The increasing adoption of high-throughput "omics" technologies has heightened the demand for standardized, scalable, and reproducible bioinformatics workflows. Nextflow and nf-core provide a robust framework for researchers, particularly early- and mid-career researchers (EMCRs), to navigate complex data analysis. At The Kids Research Institute Australia, we implemented a structured approach to bioinformatics capacity building using these tools. This perspective presents nine practical rules derived from lessons learnt, which facilitated the successful adoption of Nextflow and nf-core, addressing implementation challenges, knowledge gaps, resource allocation, and community support. Our experience serves as a guide for institutions aiming to establish sustainable bioinformatics capabilities and empower EMCRs.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Advancing bioinformatics capacity through Nextflow and nf-core: lessons from an early-to mid-career researchers–focused program at The Kids Research Institute Australia
- Date Crossref
- 29/08/2025
- Éditeur
- Frontiers Media SA
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Australian Research Council pays non établi dans la noticeOrganisme public
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The Kids Research Institute Australia pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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The University of Western Australia Medical School pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Friedrich Schiller University Jena pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Curtin University Curtin Health Innovation Research Institute (CHIRI) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Princess Margaret Hospital for Children pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Perth Children's Hospital Department of Respiratory and Sleep Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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School of Molecular Sciences Australian Research Council Centre of Excellence in Plant Energy Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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European Virus Bioinformatics Center pays non établi dans la noticeInstitution
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Wal-Yan Respiratory Research Centre pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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School of Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Population Health pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Australian Research Council, The Kids Research Institute Australia et Medical School — The University of Western Australia, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.