Large-scale statistical mapping of T-cell receptor β sequences to human leukocyte antigens
Rattachement africain : us, jp. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Introduction T-cell receptors (TCRs) interacting with peptides presented by human leukocyte antigens (HLAs) are the foundation of the adaptive immune system, but population-level analysis of TCR–HLA interactions is lacking. Methods We statistically associated approximately 106 public TCRβs to specific HLAs using TCRβ repertoires sampled from 4,144 HLA-genotyped subjects. The TCRβs we associated were specific to unique HLA allotypes, not allelic groups, and to the paired α–β heterodimer of class II HLAs, though exceptions were observed. Results This specificity permitted highly accurate imputation of 248 class I and II HLAs from the TCRβ repertoire. Notably, 45 HLA-DP and -DQ heterodimers lacked associated TCRs because they likely arise from non-functional trans-complementation. The public class I and II HLA-associated TCRβs we identified were primarily expressed on CD8+ and CD4+ memory T cells, respectively, which were responding to various common antigens. Discussion Our results recapitulate fundamental biology, provide insights into the functionality of HLAs, and demonstrate the power and potential of population-level TCRβ repertoire sequencing.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Large-scale statistical mapping of T-cell receptor β sequences to human leukocyte antigens
- Date Crossref
- 27/08/2025
- Éditeur
- Frontiers Media SA
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Microsoft (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
-
Adaptive Biotechnologies (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
-
Kanazawa University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Microsoft Research pays non établi dans la noticeInstitution
-
Faculty of Transdisciplinary Sciences for Innovation pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Microsoft (United States), Adaptive Biotechnologies (United States) et Kanazawa University, avec 2 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.