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Accès ouvert déclaré 2025 article

A bottom-up approach to find lead compounds in expansive chemical spaces

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3Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : es, ua, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Drug discovery starts with the identification of a "hit" compound that, following a long and expensive optimization process, evolves into a drug candidate. Bigger screening collections increase the odds of finding more and better hits. For this reason, large pharmaceutical companies have invested heavily in high-throughput screening (HTS) collections that can contain several million compounds. However, this figure pales in comparison with the emergent on-demand chemical collections, which have recently reached the trillion scale. These chemical collections are potentially transformative for drug discovery, as they could deliver many diverse and high-quality hits, even reaching lead-like starting points. But first, it will be necessary to develop computational tools capable of efficiently navigating such massive virtual collections. To address this challenge, we have conceived an innovative strategy that explores the chemical universe from the bottom up, performing a systematic search on the fragment space (exploration phase), to then mine the most promising areas of on-demand collections (exploitation phase). Using a hierarchy of increasingly sophisticated computational methods to remove false positives, we maximize the success probability and minimize the overall computational cost. A basic implementation of the concept has enabled us to validate the strategy prospectively, allowing the identification of new BRD4 (BD1) binders with potencies comparable to stablished drug candidates.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
A bottom-up approach to find lead compounds in expansive chemical spaces
Date Crossref
01/08/2025
Éditeur
Springer Science and Business Media LLC
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Universitat de Barcelona pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Institute for Research in Biomedicine pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Vall d'Hebron Institut de Recerca pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Vall d'Hebron Hospital Universitari pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Enamine (Ukraine) pays non établi dans la notice
    Entreprise
  • Taras Shevchenko National University of Kyiv pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • European Molecular Biology Laboratory pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Centre for Structural Systems Biology pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Universität Hamburg pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats pays non établi dans la notice
    Organisation à but non lucratif
  • Institut de Biomedicina pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Unitat de Fisicoquímica pays non établi dans la notice
    Institution

Universitat de Barcelona, Institute for Research in Biomedicine et Vall d'Hebron Institut de Recerca, avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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