Protocol for mapping 2′-O-methylation using nanopore direct RNA-seq data with NanoNm
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
2'-O-methylation (Nm) is pivotal in rRNA and the internal site of mRNA. Here, we present an integrated bioinformatics protocol for the identification of 2′-O-methylation using nanopore direct RNA sequencing (RNA-seq) data. We describe steps for software installation, data collection, and training the machine learning model. We then detail procedures for mapping 2′-O-methylation in both rRNA and mRNA in yeast and human cells. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Li et al. 1
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Protocol for mapping 2′-O-methylation using nanopore direct RNA-seq data with NanoNm
- Date Crossref
- 01/09/2025
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Les institutions déclarées
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