GrEp: Graph-based epithelial cell classification refinement in histopathology H&E images
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Le résumé fourni par la source
The automatic cell segmentation and classification from whole slide images plays an important role in digital pathology, unlocking new opportunities for biomarker discovery. Despite extensive research, this task faces persistent challenges such as the differentiation of epithelial cells into normal and malignant. Many existing models lack reporting of epithelial subtyping, and when available, their performance is often suboptimal. This work benchmarks state-of-the-art methods to highlight this limitation and introduces GrEp, a geometric deep learning strategy that considers the broader epithelium tissue architecture to infer cell-level classification rather than relying exclusively on nuclei morphology. The proposed graph-based workflow significantly outperformed state-of-the-art nuclei classification models in colorectal cancer and generalized effectively to two unseen tissue types, endometrium and pancreas, proving the robustness of the geometry-based model. Given its speed and accuracy, we believe GrEp to be a valuable method to refine epithelial cell classification for downstream analyses in clinical and research settings.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- GrEp: Graph-based epithelial cell classification refinement in histopathology H&E images
- Date Crossref
- 01/03/2026
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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University of Bern Institute of Tissue Medicine and Pathology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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ETH Zurich pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Heinrich Heine University Düsseldorf Institute of Pathology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Fribourg Image and Video Analysis Research Group pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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HES-SO University of Applied Sciences and Arts Western Switzerland pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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HES-SO Fribourg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Department of Information Technology and Electrical Engineering pays non établi dans la noticeInstitution
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University of Applied Sciences and Arts Western Switzerland (HES-SO) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Institute of Tissue Medicine and Pathology — University of Bern, ETH Zurich et Institute of Pathology — Heinrich Heine University Düsseldorf, avec 5 autres affiliations.
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