Aller au contenu principal
Accès ouvert déclaré 2025 article

A fuzzy sequencer for rapid DNA fragment counting and genotyping

1Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité
14Institutions déclarées
2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : cn, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

High-throughput sequencing technologies generate a vast number of DNA sequence reads simultaneously, which are subsequently analysed using the information contained within these fragmented reads. The assessment of sequencing technology relies on information efficiency, which measures the amount of information entropy produced per sequencing reaction cycle. Here we propose a fuzzy sequencing strategy that exhibits information efficiency more than twice that of currently prevailing cyclic reversible terminator sequencing methods. To validate our approach, we develop a fully functional and high-throughput fuzzy sequencer. This sequencer implements an efficient fluorogenic sequencing-by-synthesis chemistry and we test it across various application scenarios, including copy-number variation detection, non-invasive prenatal testing, transcriptome profiling, mutation genotyping and metagenomic profiling. Our findings demonstrate that the fuzzy sequencing strategy outperforms existing methods in terms of information efficiency and delivers accurate resequencing results with faster turnaround times.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
A fuzzy sequencer for rapid DNA fragment counting and genotyping
Date Crossref
02/07/2025
Éditeur
Springer Science and Business Media LLC
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Peking University Department of Infectious Diseases pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Center for Life Sciences pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Beijing National Laboratory for Molecular Sciences pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Cygnus (United States) pays non établi dans la notice
    Entreprise
  • Capital Medical University Beijing Obstetrics and Gynecology Hospital pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Beijing Obstetrics and Gynecology Hospital pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Peking University Third Hospital pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • State Key Laboratory of Synthetic Chemistry pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Henan Normal University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Shenzhen Bay Laboratory pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Chinese Academy of Sciences pays non établi dans la notice
    Organisme public

Department of Infectious Diseases — Peking University, Center for Life Sciences et Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Gene expression and cancer classificationGenomics and Phylogenetic StudiesGenomics and Chromatin Dynamics

BNTIC News n’est pas le producteur de ces données. Les publications sont interrogées à la demande dans Crossref, OpenAIRE, DOAJ, Europe PMC, HAL, DataCite, AfricArXiv, ROR et la Banque mondiale, sans clé d’accès. OpenAlex reste optionnel. Aucun service payant n’est nécessaire et aucune donnée externe n’est enregistrée en base. Consulter les sources et leurs limites.