A fuzzy sequencer for rapid DNA fragment counting and genotyping
Rattachement africain : cn, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
High-throughput sequencing technologies generate a vast number of DNA sequence reads simultaneously, which are subsequently analysed using the information contained within these fragmented reads. The assessment of sequencing technology relies on information efficiency, which measures the amount of information entropy produced per sequencing reaction cycle. Here we propose a fuzzy sequencing strategy that exhibits information efficiency more than twice that of currently prevailing cyclic reversible terminator sequencing methods. To validate our approach, we develop a fully functional and high-throughput fuzzy sequencer. This sequencer implements an efficient fluorogenic sequencing-by-synthesis chemistry and we test it across various application scenarios, including copy-number variation detection, non-invasive prenatal testing, transcriptome profiling, mutation genotyping and metagenomic profiling. Our findings demonstrate that the fuzzy sequencing strategy outperforms existing methods in terms of information efficiency and delivers accurate resequencing results with faster turnaround times.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- A fuzzy sequencer for rapid DNA fragment counting and genotyping
- Date Crossref
- 02/07/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Peking University Department of Infectious Diseases pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Center for Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Beijing National Laboratory for Molecular Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Cygnus (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Capital Medical University Beijing Obstetrics and Gynecology Hospital pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Beijing Obstetrics and Gynecology Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Peking University Third Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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State Key Laboratory of Synthetic Chemistry pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Henan Normal University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Shenzhen Bay Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Chinese Academy of Sciences pays non établi dans la noticeOrganisme public
Department of Infectious Diseases — Peking University, Center for Life Sciences et Beijing National Laboratory for Molecular Sciences, avec 9 autres affiliations.
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