Identification of biomarkers associated with exhausted CD8 + T cells in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma based on Mendelian randomization and bioinformatics analysis
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Le résumé fourni par la source
Intrahepatic cholangiocarcinoma (iCCA) represents a growing health concern due to its increasing incidence and poor prognosis, highlighting the urgent need for biomarkers and therapeutic targets. This study utilized BayesPrism deconvolution, Weighted Gene Co-expression Network Analysis (WGCNA), and Summary Mendelian Randomization (SMR), integrated with single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data, to analyze the tumor microenvironment. Seven distinct cell subpopulations, including Exhausted CD8 + T cells (Tex), were identified. Notably, scPagwas analysis revealed gene enrichment in UQCRH, HINT1, and AKR1C3, associated with Tex. BayesPrism analysis confirmed their increased presence in the tumor microenvironment, indicating a role in immune evasion. WGCNA identified 594 genes linked to these cells, with PNO1 and AKR1C5P emerging as potential disease-associated genes. These findings highlight the critical role of Tex in immune suppression and identify key genes for further investigation in iCCA progression and treatment strategies.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Identification of biomarkers associated with exhausted CD8 + T cells in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma based on Mendelian randomization and bioinformatics analysis
- Date Crossref
- 13/06/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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First Affiliated Hospital of Xiamen University pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Harbin Medical University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Third Affiliated Hospital of Harbin Medical University pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Fujian Medical University Department of Orthopaedics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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First Affiliated Hospital of Fujian Medical University pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Putian University Department of Basic Medical Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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School of Medicine Department of Hepato-Biliary-Pancreatic and Vascular Surgery pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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