DockTox: Targeting molecular initiating events in organ toxicity through molecular docking
Rattachement africain : es, it, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Adverse Outcome Pathways (AOPs) in toxicology describe the sequence of key events from chemical exposure to adverse outcomes, facilitating the development of predictive models. The EU ONTOX project uses this framework to predict liver, developmental brain, and kidney toxicity without animal testing. Focusing on Molecular Initiating Events (MIEs), more concretely on the interaction of chemicals with key proteins, we have developed an automated workflow for docking small molecules onto over 20 pre-processed protein structures, implemented in the online tool DockTox. This tool generates conformers of small molecules, performs docking on MIE-associated proteins, and provides binding energy, interacting residues, and interaction maps. Additionally, it compares the interactions to a reference list of known ligands, producing an interaction fraction as an additional similarity measure. Evaluation of the docking workflow's predictive performance on Peroxisome Proliferator-Activated Receptor α (PPARα) showed that interaction fraction values are more informative than binding energy alone for distinguishing binders from non-binders. This unique feature enhances the understanding of target protein interactions. DockTox supports the virtual screening of small molecules targeting MIE-associated proteins, offering insights into binding energies and interaction profiles. It is a valuable tool for anticipating adverse outcomes from chemical exposure in a tiered risk assessment approach.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- DockTox: Targeting molecular initiating events in organ toxicity through molecular docking
- Date Crossref
- 01/08/2025
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Parque Tecnológico de la Salud pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
Instituto Tecnologico Del Embalaje pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Mario Negri Institute for Pharmacological Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Istituti di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
Bayer (Germany) pays non établi dans la noticeEntreprise
-
ProtoQSAR SL pays non établi dans la noticeInstitution
-
Laboratory of Environmental Chemistry and Toxicology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Bayer AG pays non établi dans la noticeInstitution
Parque Tecnológico de la Salud, Instituto Tecnologico Del Embalaje et Mario Negri Institute for Pharmacological Research, avec 5 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.