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Drugit: crowd-sourcing molecular design of non-peptidic VHL binders

Thomas Allan Scott, Christian Alan Paul Smethurst, Yvonne Westermaier, Moriz Mayer, Peter Greb, Roland Kousek, Tobias Biberger, Gerd Bader, Zuzana Jandová, Philipp S. Schmalhorst, Julian E. Fuchs, Aniket Magarkar, Christoph Hoenke, Thomas Gerstberger, Steven A. Combs, Richard Pape, Saksham Phul, Sandeepkumar Kothiwale, Andreas Bergner

3Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité

8Institutions déclarées

3Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : us, at, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Building on the role of human intuition in small molecule drug design, we explored whether crowdsourcing could recruit citizen scientists to this task while in parallel building awareness for this scientific process. Here, we introduce Drugit ( https://drugit.org ), the small molecule design mode of the online citizen science game Foldit. We demonstrate its utility by identifying distinct binders to the von Hippel Lindau E3 ligase. Several thousand molecules were suggested by players in a series of ten puzzle rounds. The proposed molecules were further evaluated in silico and manually by an expert panel. Selected candidates were synthesized and tested. One of these molecules shows dose-dependent shift perturbations in protein-observed NMR experiments. The co-crystal structure in complex with the E3 ligase reveals that the observed binding mode matches the player's original idea. The completion of one full design cycle is a proof of concept for the Drugit approach and highlights the potential of involving citizen scientists in early drug discovery.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Drugit: crowd-sourcing molecular design of non-peptidic VHL binders
Date Crossref: 14/04/2025
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
Type: journal-article

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Où se fait cette recherche

Vanderbilt University Center for Structural Biology pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Boehringer Ingelheim (Austria) pays non établi dans la notice
Entreprise
Boehringer Ingelheim (Germany) pays non établi dans la notice
Entreprise
Vanderbilt Health pays non établi dans la notice
Entreprise
Leipzig University of Applied Sciences pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
German Research Centre for Artificial Intelligence pays non établi dans la notice
Organisme public
Center for Scalable Data Analytics and Artificial Intelligence pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Leipzig University pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Boehringer Ingelheim RCV pays non établi dans la notice
Institution
Boehringer Ingelheim Pharma GmbH & Co. KG pays non établi dans la notice
Entreprise
Vanderbilt Institute of Chemical Biology pays non établi dans la notice
Structure de recherche
Faculty of Chemistry and Mineralogy pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure

Center for Structural Biology — Vanderbilt University, Boehringer Ingelheim (Austria) et Boehringer Ingelheim (Germany), avec 9 autres affiliations.

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