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Accès ouvert déclaré 2025 article

Molecular basis for the calcium-dependent activation of the ribonuclease EndoU

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Rattachement africain : fr, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Ribonucleases (RNases) are ubiquitous enzymes that process or degrade RNA, essential for cellular functions and immune responses. The EndoU-like superfamily includes endoribonucleases conserved across bacteria, eukaryotes, and certain viruses, with an ancient evolutionary link to the ribonuclease A-like superfamily. Both bacterial EndoU and animal RNase A share a similar fold and function independently of cofactors. In contrast, the eukaryotic EndoU catalytic domain requires divalent metal ions for catalysis, possibly due to an N-terminal extension near the catalytic core. In this study, we use biophysical and computational techniques along with in vitro assays to investigate the calcium-dependent activation of human EndoU. We determine the crystal structure of EndoU bound to calcium and find that calcium binding remote from the catalytic triad triggers water-mediated intramolecular signaling and structural changes, activating the enzyme through allostery. Calcium binding involves residues from both the catalytic core and the N-terminal extension, indicating that the N-terminal extension interacts with the catalytic core to modulate activity in response to calcium. Our findings suggest that similar mechanisms may be present across all eukaryotic EndoUs, highlighting a unique evolutionary adaptation that connects endoribonuclease activity to cellular signaling in eukaryotes. Eucaryotic EndoU are endoribonucleases that require calcium ions to cleave RNA substrates. Here, the authors solved the structure of calcium-activated human EndoU and proposed a structural model for U-rich RNA recognition, revealing how calcium ions allosterically activate the enzyme.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Molecular basis for the calcium-dependent activation of the ribonuclease EndoU
Date Crossref
01/04/2025
Éditeur
Springer Science and Business Media LLC
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la notice
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  • Université de Bordeaux pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Inserm pays non établi dans la notice
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  • Bordeaux Population Health pays non établi dans la notice
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  • Institut Européen de Chimie et Biologie pays non établi dans la notice
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  • Acides nucléiques: Régulations naturelles et artificielles pays non établi dans la notice
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  • University of California Department of Molecular pays non établi dans la notice
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  • CNRS Univ. Bordeaux pays non établi dans la notice
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Centre National de la Recherche Scientifique, Université de Bordeaux et Inserm, avec 5 autres affiliations.

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