Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
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Le résumé fourni par la source
In response to stress, cells activate signaling pathways that coordinate broad changes in gene expression to enhance cell survival. Remarkably, complex variations in gene expression occur even in isogenic populations and in response to similar signaling inputs. However, the molecular mechanisms underlying this variability and their influence on adaptive cell fate decisions are not fully understood. Here, we use scRNA-seq to longitudinally assess transcriptional dynamics during osmoadaptation in yeast. Our findings reveal highly heterogeneous expression of the osmoresponsive program, which organizes into combinatorial patterns that generate distinct cellular programs. The induction of these programs is favored by global transcriptome repression upon stress. Cells displaying basal expression of the osmoresponsive program are hyper-responsive and resistant to stress. Through a transcription-focused analysis of more than 300 RNA-barcoded deletion mutants, we identify genetic factors that shape the heterogeneity of the osmostress-induced transcriptome, define regulators of stress-related subpopulations and find a link between transcriptional heterogeneity and increased cell fitness. Our findings provide a regulatory map of the complex transcriptional phenotypes underlying osmoadaptation in yeast and highlight the importance of transcriptional heterogeneity in generating distinct adaptive strategies.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Transcriptional heterogeneity shapes stress-adaptive responses in yeast
- Date Crossref
- 17/03/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Universitat Pompeu Fabra pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institute for Research in Biomedicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Lausanne pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Sorbonne Université Institut Curie pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut Curie pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Department of Medicine and Life Sciences pays non établi dans la noticeInstitution
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Faculty of Biology and Medicine Department of Fundamental Microbiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Universitat Pompeu Fabra, Institute for Research in Biomedicine et University of Lausanne, avec 6 autres affiliations.
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