Genome-Wide Association Study and Genomic Prediction of Soybean Mosaic Virus Resistance
Rattachement africain : cn, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Soybean mosaic virus (SMV), a pathogen responsible for inducing leaf mosaic or necrosis symptoms, significantly compromises soybean seed yield and quality. According to the classification system in the United States, SMV is categorized into seven distinct strains (G1 to G7). In this study, we performed a genome-wide association study (GWAS) in GAPIT3 using four analytical models (MLM, MLMM, FarmCPU, and BLINK) on 218 soybean accessions. We identified 22 SNPs significantly associated with G1 resistance across chromosomes 1, 2, 3, 12, 13, 17, and 18. Notably, a major quantitative trait locus (QTL) spanning 873 kb (29.85–30.73 Mb) on chromosome 13 exhibited strong association with SMV G1 resistance, including the four key SNP markers: Gm13_29459954_ss715614803, Gm13_29751552_ss715614847, Gm13_30293949_ss715614951, and Gm13_30724301_ss715615024. Within this QTL, four candidate genes were identified: Glyma.13G194100, Glyma.13G184800, Glyma.13G184900, and Glyma.13G190800 (3Gg2). The genomic prediction (GP) accuracies ranged from 0.60 to 0.83 across three GWAS-derived SNP sets using five models, demonstrating the feasibility of GP for SMV-G1 resistance. These findings could provide a useful reference in soybean breeding targeting SMV-G1 resistance.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genome-Wide Association Study and Genomic Prediction of Soybean Mosaic Virus Resistance
- Date Crossref
- 27/02/2025
- Éditeur
- MDPI AG
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Hebei Agricultural University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Agricultural Research Service pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Beltsville Agricultural Research Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Arkansas at Fayetteville Department of Horticulture pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Northwest A&F University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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College of Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institute of Cereal and Oil Crops pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Soybean Genomics and Improvement Laboratory pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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College of Agronomy pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Hebei Agricultural University, Hebei Academy of Agriculture and Forestry Sciences et Agricultural Research Service, avec 7 autres affiliations.
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