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Accès ouvert déclaré 2025 preprint

Atlas of the Bacterial Serine-Threonine Kinases expands the functional diversity of the kinome

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Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract Bacterial serine-threonine protein kinases (STKs) regulate diverse cellular processes associated with cell growth, virulence, and pathogenicity. They are evolutionarily related to the druggable eukaryotic STKs. However, an incomplete knowledge of how bacterial STKs differ from their eukaryotic counterparts and how they have diverged to regulate diverse bacterial signaling functions presents a bottleneck in targeting them for drug discovery efforts. Here, we classified over 300,000 bacterial STK sequences from the NCBI RefSeq non-redundant and UniProt protein databases into 35 canonical and seven non-canonical (pseudokinase) families based on the patterns of evolutionary constraints in the conserved catalytic domain and flanking regulatory domains. Through statistical comparisons, we identified distinguishing features of bacterial STKs, including a distinctive arginine residue in a regulatory helix (C-Helix) that dynamically couples ATP and substrate binding lobes of the kinase domain. Biochemical and peptide-library screens demonstrated that constrained residues contribute to substrate specificity and kinase activation in the Mycobacterium tuberculosis kinase PknB. Collectively, these findings open new avenues for investigating bacterial STK functions in cellular signaling and for the development of selective bacterial STK inhibitors.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Atlas of the Bacterial Serine-Threonine Kinases expands the functional diversity of the kinome
Date Crossref
15/01/2025
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • University of Georgia Department of Biochemistry & Molecular Biology pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Cornell University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Weill Cornell Medicine pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Columbia University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Harvard University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Dana-Farber Cancer Institute pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Englander Institute for Precision Medicine pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Meyer Cancer Center pays non établi dans la notice
    Institution
  • Department of Cell Biology pays non établi dans la notice
    Institution
  • Harvard Medical School pays non établi dans la notice
    Institution

Department of Biochemistry & Molecular Biology — University of Georgia, Cornell University et Weill Cornell Medicine, avec 7 autres affiliations.

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