Enhancing multi-omic analyses through a federated microbiome analysis service
Rattachement africain : gb, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Multi-omics datasets are an increasingly prevalent and necessary resource for achieving scientificadvances in microbial ecosystem research. However, they present twin challenges to researchinfrastructures: firstly the utility of multi-omics datasets relies entirely on interoperability ofomics layers, i.e. on formalised data linking. Secondly, microbiome derived data typically leadto computationally expensive analyses, and so rely on the availability of high performancecomputing (HPC) or cloud infrastructures. These challenges can be better met by combining the resources of multiple groups, services and infrastructures. In this BioHackathon Europe 2024 project, we envisioned a "federated microbiome analysis service" and worked on three tracks of development towards it: mapping metagenomics metadata standards to Schema.org and Bioschemas terms, rendering Nextflow workflow executions as RO-Crates, and tooling for creating, viewing and interlinking human-readable RO-Crate previews.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Enhancing multi-omic analyses through a federated microbiome analysis service
- Date Crossref
- 06/01/2025
- Éditeur
- Center for Open Science
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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European Bioinformatics Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Bernstein Center for Computational Neuroscience Tübingen pays non établi dans la noticeOrganisme public
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University of Tübingen Quantitative Biology Center pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Freiburg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Newcastle University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Forschungszentrum Jülich pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Bielefeld University Center for Biotechnology (CeBiTec) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Hospital Tübingen Institute for Translational Bioinformatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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BioHackathon Europe 2024 Barcelona pays non établi dans la noticeInstitution
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Institute of Bio-and Geosciences (IBG) Computational Metagenomics pays non établi dans la noticeStructure de recherche
European Bioinformatics Institute, Bernstein Center for Computational Neuroscience Tübingen et Quantitative Biology Center — University of Tübingen, avec 7 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.