The giant genome of lily provides insights into the hybridization of cultivated lilies
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Le résumé fourni par la source
Lilies are economically important monocots known for their ornamental flowers, bulbs, and large genomes. The absence of their genomic information has impeded evolutionary studies and genome-based breeding efforts. Here, we present reference genomes for Lilium sargentiae (lily, 35.66 Gb) and Gloriosa superba (flame lily, 5.09 Gb). The giant lily genome is shaped by recent long terminal repeat retroelements. Phylogenetic analysis reveals diverse, independent origins of lily cultivars. Gene families involved in sucrose and starch metabolism are significantly expanded in the lily genome. Key homologs of XTH22, SOC1, and AP1/FUL-like genes regulate the development, bud growth transition, and floral bud growth transition of lily bulbs. Colchicine biosynthetic gene clusters are identified in G. superba but are absent in L. sargentiae, highlighting independent colchicine evolution in Colchicaceae. These genomic insights enhance understanding of Liliales evolution, providing a foundation for future breeding and molecular research. Lilies are perennial plants with ornamental flowers and large genomes. The authors assemble genomes of two Liliales species, analyze lily phylogeny, flower and stem development (bulbs in lilies, rhizomes in flame lilies), bulb growth transitions, and colchicine biosynthesis.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- The giant genome of lily provides insights into the hybridization of cultivated lilies
- Date Crossref
- 02/01/2025
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Zhejiang University Zhejiang Key Laboratory of Horticultural Crop Quality Improvement pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Yunnan Academy of Agricultural Sciences pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institute of Grassland Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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China Agricultural University Beijing Key Laboratory of Development and Quality Control of Ornamental Crops pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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North China University of Science and Technology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Huazhong Agricultural University National Key Laboratory for Germplasm Innovation & Utilization of Horticultural Crops pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Zhejiang Sci-Tech University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Yunnan Agricultural University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Western Sydney University Hawkesbury Institute for the Environment pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Helmholtz Munich pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Technical University of Munich pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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South China Agricultural University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Zhejiang Key Laboratory of Horticultural Crop Quality Improvement — Zhejiang University, Yunnan Academy of Agricultural Sciences et Institute of Grassland Research, avec 9 autres affiliations.
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