A Diagnostic Blind Spot: Deep intronic SVA_E Insertion identified as the most Common Pathogenic Variant Associated with Canavan Disease
Rattachement africain : us, au, uy, ca. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Canavan disease (CD) is a neurodegenerative disorder caused by biallelic disease-causing variants in the ASPA gene. Here, we utilized long-read sequencing (LRS) to investigate eight individuals clinically diagnosed with Canavan disease but without definitive genetic diagnoses. Our analyses identified a recurring previously unreported intronic SVA_E retrotransposon insertion within ASPA in all eight individuals. Surprisingly, the frequency of this variant in population databases suggests it is the most common pathogenic variant in ASPA and should be evaluated in diagnostic testing and carrier screening for CD. Additionally, this finding has implications for the broader rare disease community, as it highlights a substantial blind spot in standard short-read diagnostic pipelines, which historically have missed or overlooked these types of insertions. This discovery highlights the power of emerging technologies, such as LRS and RNA-sequencing (RNA-seq), to bring new classes of variants into diagnostic utility for genetic disorders like CD.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- A Diagnostic Blind Spot: Deep intronic SVA_E Insertion identified as the most Common Pathogenic Variant Associated with Canavan Disease
- Date Crossref
- 21/12/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Children's Hospital of Philadelphia Department of Radiology pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Murdoch Children's Research Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Centro Hospitalario Pereira Rossell pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Royal Children's Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Royal Ottawa Mental Health Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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The University of Melbourne pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Garvan Institute of Medical Research pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of Washington Department of Pediatrics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centro de Referencia Nacional de Defectos Congenitos y Enfermedades Raras (CRENADECER) pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
Department of Radiology — Children's Hospital of Philadelphia, Murdoch Children's Research Institute et Centro Hospitalario Pereira Rossell, avec 6 autres affiliations.
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