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Accès ouvert déclaré 2024 article

Tagless LysoIP for immunoaffinity enrichment of native lysosomes from clinical samples

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4Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : gb, us, de, nl. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Lysosomes are implicated in a wide spectrum of human diseases, including monogenic lysosomal storage disorders (LSDs), age-associated neurodegeneration, and cancer. Profiling lysosomal content using tag-based lysosomal immunoprecipitation (LysoTagIP) in cell and animal models has substantially moved the field forward, but studying lysosomal dysfunction in patients remains challenging. Here, we report the development of the 'tagless LysoIP' method, designed to enable the rapid enrichment of lysosomes, via immunoprecipitation, using the endogenous integral lysosomal membrane protein TMEM192, directly from clinical samples and human cell lines (e.g., induced pluripotent stem cell-derived neurons). Isolated lysosomes were intact and suitable for subsequent multimodal omics analyses. To validate our approach, we applied the tagless LysoIP to enrich lysosomes from peripheral blood mononuclear cells derived from fresh blood of healthy donors and patients with CLN3 disease, an autosomal recessive neurodegenerative LSD. Metabolic profiling of isolated lysosomes revealed massive accumulation of glycerophosphodiesters (GPDs) in patients' lysosomes. Interestingly, a patient with a milder phenotype and genotype displayed lower accumulation of lysosomal GPDs, consistent with their potential role as disease biomarkers. Altogether, the tagless LysoIP provides a framework to study native lysosomes from patient samples, identify disease biomarkers, and discover human-relevant disease mechanisms.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Tagless LysoIP for immunoaffinity enrichment of native lysosomes from clinical samples
Date Crossref
26/12/2024
Éditeur
American Society for Clinical Investigation
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • University of Dundee pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • MRC Protein Phosphorylation and Ubiquitylation Unit pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Research Network (United States) pays non établi dans la notice
    Entreprise
  • Medical Research Council pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Stanford University The Institute for Chemistry pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Universitätsklinikum Erlangen pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Utrecht University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University Medical Center Utrecht Department of Metabolic diseases pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Wilhelmina Children's Hospital pays non établi dans la notice
    Établissement de santé
  • Universität Hamburg pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • University Medical Center Hamburg-Eppendorf Department of Pediatrics pays non établi dans la notice
    Établissement de santé

University of Dundee, MRC Protein Phosphorylation and Ubiquitylation Unit et Research Network (United States), avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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