Identifying the unknown: Application of molecular epidemiology tools to identify clustering and HIV transmission routes in Poland
Rattachement africain : pl, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
BACKGROUND: Understanding the dynamics of HIV-1 transmission is essential for developing effective screening and intervention strategies. Viral genetic sequences provide valuable information that can be used to infer the history and patterns of viral transmission. PURPOSE: Our study explores the structure and dynamics of HIV transmissions in Poland from 1999 to 2022 to elucidate key patterns related with national epidemics. METHODS: To understand the temporal dynamics of transmission routes we examined HIV pol sequence data from 5705 Polish PWH. The HIV-TRAnsmission Cluster Engine (HIV-TRACE) was utilized to identify potential links between different risk groups and putative links to individuals with unreported transmission risk. RESULTS: Our analyses generated 503 clusters, containing 3942 individuals, and identified 13,917 putative links. Approximately 69.1 % of the sequences formed clusters. In the dataset 32.2 % of individuals were reported MSM transmission route, 7.9 % by heterosexual, and 5.6 % by PWID transmissions. The transmission route was unknown for 54.2 % of patients. Putative transmissions from MSM to all other groups revealed that 45.1 % of links lead to people with unregistered transmission mode. For heterosexual patients, 40.2 % of connections were directed to patients lacking information on infection routes and 30.5 % to MSM individuals. Our analysis unveiled that 45.1 % of cases with unreported transmission routes may be identified as MSM, while 3.5 % might be potential non-disclosed MSM. CONCLUSIONS: Genetic linkages can provide valuable insights into the transmission dynamics among individuals, even in cases where transmission risk information is missing or unreported. The observed association between MSM and unreported cases highlights the potential of molecular epidemiology to complete missing patient data.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Identifying the unknown: Application of molecular epidemiology tools to identify clustering and HIV transmission routes in Poland
- Date Crossref
- 01/07/2025
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Pomeranian Medical University Department of Infectious pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Cardinal Stefan Wyszynski University in Warsaw pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Medical University of Warsaw Department of Infectious and Tropical Diseases and Hepatology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Jagiellonian University Department of Infectious and Tropical Diseases pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Poznan University of Medical Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Heliodor Swiecicki Clinical Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Wroclaw Medical University Department of Infectious Diseases pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Gdansk School of Higher Education pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Baltic Sea Cultural Centre in Gdańsk pays non établi dans la noticeInstitution
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University of Warmia and Mazury in Olsztyn pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Nicolaus Copernicus University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Zielona Góra pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Department of Infectious — Pomeranian Medical University, Cardinal Stefan Wyszynski University in Warsaw et Department of Infectious and Tropical Diseases and Hepatology — Medical University of Warsaw, avec 9 autres affiliations.
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