InterPro: the protein sequence classification resource in 2025
Rattachement africain : gb, de, ch, us, it. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
InterPro (https://www.ebi.ac.uk/interpro) is a freely accessible resource for the classification of protein sequences into families. It integrates predictive models, known as signatures, from multiple member databases to classify sequences into families and predict the presence of domains and significant sites. The InterPro database provides annotations for over 200 million sequences, ensuring extensive coverage of UniProtKB, the standard repository of protein sequences, and includes mappings to several other major resources, such as Gene Ontology (GO), Protein Data Bank in Europe (PDBe) and the AlphaFold Protein Structure Database. In this publication, we report on the status of InterPro (version 101.0), detailing new developments in the database, associated web interface and software. Notable updates include the increased integration of structures predicted by AlphaFold and the enhanced description of protein families using artificial intelligence. Over the past two years, more than 5000 new InterPro entries have been created. The InterPro website now offers access to 85 000 protein families and domains from its member databases and serves as a long-term archive for retired databases. InterPro data, software and tools are freely available.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- InterPro: the protein sequence classification resource in 2025
- Date Crossref
- 20/11/2024
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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European Bioinformatics Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institute of Structural and Molecular Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University College London Department of Structural and Molecular Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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European Molecular Biology Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisme public
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SIB Swiss Institute of Bioinformatics Swiss-Prot Group pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Google (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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MRC Laboratory of Molecular Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Medical Research Council pays non établi dans la noticeOrganisme public
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National Institutes of Health National Library of Medicine pays non établi dans la noticeOrganisme public
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National Center for Biotechnology Information pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Biobyte Solutions (Germany) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Google DeepMind (United Kingdom) pays non établi dans la noticeEntreprise
European Bioinformatics Institute, Institute of Structural and Molecular Biology et Department of Structural and Molecular Biology — University College London, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.