Genomic analysis of Brucella isolates from animals and humans, Türkiye, 2010 to 2020
Rattachement africain : tr, de, gr, Égypte. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Background Brucellosis is a bacterial zoonosis causing severe illness in humans and animals and leading to economic losses in the livestock production in Türkiye and other endemic countries. Aim We aimed at investigating genomic differences of Brucella isolates from animals and humans in Türkiye. Methods We used whole genome sequencing (WGS) to assess the genetic diversity of Brucella isolates from 41 provinces in Türkiye and compared with isolates from other countries. We applied allele-based typing and core genome single nucleotide polymorphism (cgSNP) determination. Results Of the 106 Turkish Brucella isolates included, 57 were B. abortus and 49 were B. melitensis. One B. melitensis and two B. abortus isolates were identified as vaccine strains. Most (n = 55) B. abortus isolates clustered in three major branches, with no spatial discernible pattern. Of the B. melitensis isolates, 48 were assigned to the Eastern Mediterranean lineage with no discernible patterns between host species, location and sampling date. The Turkish isolates clustered with isolates from neighbouring countries such as Greece and Syria, but some also with isolates from human patients in European countries, like Germany, Norway and Sweden, suggesting that the source may be travel-related. Conclusion Several B. melitensis and B. abortus lineages are circulating in Türkiye. To decrease the prevalence and prevent brucellosis in animals and humans, stricter control measures are needed, particularly in areas where humans and animals have close contact. Furthermore, illegal transportation of animals across borders should be more closely controlled and regulated.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genomic analysis of Brucella isolates from animals and humans, Türkiye, 2010 to 2020
- Date Crossref
- 19/09/2024
- Éditeur
- European Centre for Disease Control and Prevention (ECDC)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Friedrich-Loeffler-Institut pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Harran University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Crete pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Hellenic Agricultural Organization - DIMITRA pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Benha University Benha University, Égypte (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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Jena University Hospital Institute of Infectious Diseases and Infection Control pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Faculty of Veterinary Medicine Department of Microbiology Benha University, Égypte (pays nommé en fin d’affiliation)Université ou école supérieure
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Institute of Bacterial Infections and Zoonoses pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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National Reference Laboratory (NRL) for Brucellosis pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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School of Medicine Department of Clinical Microbiology and Microbial Pathogenesis pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Veterinary Research Institute Hellenic Agricultural Organization-DIMITRA pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi, Friedrich-Loeffler-Institut et Harran University, avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Égypte.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.