Integrated epigenomic exposure signature discovery
Rattachement africain : us, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Aim: The epigenome influences gene regulation and phenotypes in response to exposures. Epigenome assessment can determine exposure history aiding in diagnosis.Materials & methods: Here we developed and implemented a machine learning algorithm, the exposure signature discovery algorithm (ESDA), to identify the most important features present in multiple epigenomic and transcriptomic datasets to produce an integrated exposure signature (ES).Results: Signatures were developed for seven exposures including Staphylococcus aureus, human immunodeficiency virus, SARS-CoV-2, influenza A (H3N2) virus and Bacillus anthracis vaccinations. ESs differed in the assays and features selected and predictive value.Conclusion: Integrated ESs can potentially be utilized for diagnosis or forensic attribution. The ESDA identifies the most distinguishing features enabling diagnostic panel development for future precision health deployment.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Integrated epigenomic exposure signature discovery
- Date Crossref
- 17/07/2024
- Éditeur
- Informa UK Limited
- Type
- journal-article
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Les institutions déclarées
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