Mining human microbiomes reveals an untapped source of peptide antibiotics
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Drug-resistant bacteria are outpacing traditional antibiotic discovery efforts. Here, we computationally screened 444,054 previously reported putative small protein families from 1,773 human metagenomes for antimicrobial properties, identifying 323 candidates encoded in small open reading frames (smORFs). To test our computational predictions, 78 peptides were synthesized and screened for antimicrobial activity in vitro, with 70.5% displaying antimicrobial activity. As these compounds were different compared with previously reported antimicrobial peptides, we termed them smORF-encoded peptides (SEPs). SEPs killed bacteria by targeting their membrane, synergizing with each other, and modulating gut commensals, indicating a potential role in reconfiguring microbiome communities in addition to counteracting pathogens. The lead candidates were anti-infective in both murine skin abscess and deep thigh infection models. Notably, prevotellin-2 from Prevotella copri presented activity comparable to the commonly used antibiotic polymyxin B. Our report supports the existence of hundreds of antimicrobials in the human microbiome amenable to clinical translation.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Mining human microbiomes reveals an untapped source of peptide antibiotics
- Date Crossref
- 01/09/2024
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Translational Therapeutics (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
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University of Pennsylvania pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Stanford Blood Center pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Stanford University Department of Medicine (Hematology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Perelman School of Medicine Departments of Psychiatry and Microbiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Translational Therapeutics (United States), University of Pennsylvania et Stanford Blood Center, avec 2 autres affiliations.
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