Refined Enterotyping Reveals Dysbiosis in Global Fecal Metagenomes
Rattachement africain : de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Summary Background Enterotypes describe human fecal microbiomes grouped by similarity into clusters of microbial community composition, often associated with disease, medications, diet, and lifestyle. Numbers and determinants of enterotypes have been derived by diverse frameworks and applied to cohorts that often lack diversity or inter-cohort comparability. Results To overcome these limitations, we selected 16,772 fecal metagenomes collected from 38 countries to revisit the enterotypes using state-of-the-art fuzzy clustering and found robust clustering regardless of underlying taxonomy, consistent with previous findings. Quantifying the strength of enterotype classifications enriched the enterotype landscape, also reflecting some continuity of microbial compositions. As the classification strength was associated with the patient’s health status, we established an “Enterotype Dysbiosis Score” (EDS) as a latent covariate for various diseases. Conclusion This global study confirms the enterotypes, reveals a dysbiosis signal within the enterotype landscape, and enables robust classification of metagenomes with an online “Enterotyper” tool, allowing reproducible analysis in future studies. Graphical Abstract
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Refined Enterotyping Reveals Dysbiosis in Global Fecal Metagenomes
- Date Crossref
- 13/08/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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European Molecular Biology Laboratory pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Biobyte Solutions (Germany) pays non établi dans la noticeEntreprise
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University Hospital Münster pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Max Delbrück Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of Würzburg Department of Bioinformatics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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biobyte solutions GmbH pays non établi dans la noticeEntreprise
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University Hospital Muenster Department of Internal Medicine B pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Max Delbrück Centre for Molecular Medicine pays non établi dans la noticeInstitution
European Molecular Biology Laboratory, Biobyte Solutions (Germany) et University Hospital Münster, avec 5 autres affiliations.
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