Bacillus anthracis in South Africa, 1975–2013: are some lineages vanishing?
Rattachement africain : Afrique du Sud, de, fr. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The anthrax-causing bacterium Bacillus anthracis comprises the genetic clades A, B, and C. In the northernmost part (Pafuri) of Kruger National Park (KNP), South Africa, both the common A and rare B strains clades occur. The B clade strains were reported to be dominant in Pafuri before 1991, while A clade strains occurred towards the central parts of KNP. The prevalence of B clade strains is currently much lower as only A clade strains have been isolated from 1992 onwards in KNP. In this study 319 B. anthracis strains were characterized with 31-loci multiple-locus variable-number tandem repeat analysis (MLVA-31). B clade strains from soil (n = 9) and a Tragelaphus strepsiceros carcass (n = 1) were further characterised by whole genome sequencing and compared to publicly available genomes. The KNP strains clustered in the B clade before 1991 into two dominant genotypes. South African strains cluster into a dominant genotype A.Br.005/006 consisting of KNP as well as the other anthrax endemic region, Northern Cape Province (NCP), South Africa. A few A.Br.001/002 strains from both endemic areas were also identified. Subclade A.Br.101 belonging to the A.Br.Aust94 lineage was reported in the NCP. The B-clade strains seems to be vanishing, while outbreaks in South Africa are caused mainly by the A.Br.005/006 genotypes as well as a few minor clades such as A.Br.001/002 and A.Br.101 present in NCP. This work confirmed the existence of the rare and vanishing B-clade strains that group in B.Br.001 branch with KrugerB and A0991 KNP strains.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Bacillus anthracis in South Africa, 1975–2013: are some lineages vanishing?
- Date Crossref
- 30/07/2024
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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North-West University Unit for Environmental Sciences and Management: Microbiology Potchefstroom campus, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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Onderstepoort Veterinary Academic Hospital Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Établissement de santé
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University of Pretoria University of Pretoria, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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University of South Africa Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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National Health Laboratory Service Centre for Emerging Zoonotic and Parasitic Diseases Johannesburg, Afrique du Sud (code pays fourni par la source)Organisme public
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National Institute for Communicable Diseases pays non établi dans la noticeOrganisme public
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University of Hohenheim Institute of Environmental and Animal Hygiene pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Commissariat à l'Énergie Atomique et aux Énergies Alternatives pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Paris-Saclay CNRS pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut de Biologie Intégrative de la Cellule pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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CEA Paris-Saclay pays non établi dans la noticeOrganisme public
Unit for Environmental Sciences and Management: Microbiology — North-West University (Potchefstroom campus, Afrique du Sud), Onderstepoort Veterinary Academic Hospital (Afrique du Sud) et University of Pretoria (University of Pretoria, Afrique du Sud), avec 9 autres affiliations. Pays d’affiliation : Afrique du Sud.
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