Experience of an Egyptian tertiary Laboratory in the diagnosis of tuberculous and non-tuberculous Mycobacterial Infections: A five-year retrospective study.
Rattachement africain : Égypte. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Background: Tuberculosis (TB) is one of the significant health concerns in Egypt, necessitating rapid, affordable, and accurate diagnosis to aid in its control. This study presents data collected over five years (2017-2021) to explore different diagnostic TB methods in our lab. Methods: A total of 33700 non-repetitive samples were subjected to different diagnostic methods; 30000 were stained by Ziehl–Neelsen (ZN), of which 2819 were cultured on Löwenstein-Janssen (LJ) media, and 456 were analyzed by GeneXpert; 3700 samples were tested by interferon-gamma release assay (IGRA) Quantiferon. Moreover, 3650 patients underwent the tuberculin skin test (TST). Results: GeneXpert displayed the highest positivity (23.9%), while ZN smear microscopy was the lowest (4.8%). The detection capability between pulmonary and extrapulmonary samples was not statistically significant using LJ culture but significant using GeneXpert MTB/RIF. Rifampicin resistance was 17.4% among the GeneXpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)-positive samples. Conclusions: GeneXpert MTB/RIF assay is a user-friendly, rapid, and efficient method for identifying pulmonary and extrapulmonary TB with the simultaneous detection of rifampicin-resistant strains. However, culture and smear microscopy remain the most dominant diagnostic methods in developing countries due to their low cost and relatively acceptable specificity.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Experience of an Egyptian tertiary Laboratory in the diagnosis of tuberculous and non-tuberculous Mycobacterial Infections: A five-year retrospective study.
- Date Crossref
- 11/06/2024
- Éditeur
- Egyptian Knowledge Bank
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Ministry of Health and Population Égypte (code pays fourni par la source)Organisme public
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Arab Academy for Science Égypte (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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Alexandria University Department of Microbiology Égypte (code pays fourni par la source)Université ou école supérieure
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College of Pharmacy Department of Microbiology and Biotechnology Égypte (pays nommé en fin d’affiliation)Université ou école supérieure
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Faculty of Medicine Department of Medical Microbiology and Immunology Égypte (pays nommé en fin d’affiliation)Université ou école supérieure
Ministry of Health and Population (Égypte), Arab Academy for Science (Égypte) et Department of Microbiology — Alexandria University (Égypte), avec 2 autres affiliations. Pays d’affiliation : Égypte.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.