Spatial mapping of mobile genetic elements and their bacterial hosts in complex microbiomes
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The exchange of mobile genetic elements (MGEs) facilitates the spread of functional traits including antimicrobial resistance within bacterial communities. Tools to spatially map MGEs and identify their bacterial hosts in complex microbial communities are currently lacking, limiting our understanding of this process. Here we combined single-molecule DNA fluorescence in situ hybridization (FISH) with multiplexed ribosomal RNA-FISH to enable simultaneous visualization of both MGEs and bacterial taxa. We spatially mapped bacteriophage and antimicrobial resistance (AMR) plasmids and identified their host taxa in human oral biofilms. This revealed distinct clusters of AMR plasmids and prophage, coinciding with densely packed regions of host bacteria. Our data suggest spatial heterogeneity in bacterial taxa results in heterogeneous MGE distribution within the community, with MGE clusters resulting from horizontal gene transfer hotspots or expansion of MGE-carrying strains. Our approach can help advance the study of AMR and phage ecology in biofilms.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Spatial mapping of mobile genetic elements and their bacterial hosts in complex microbiomes
- Date Crossref
- 25/06/2024
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
Cornell University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Signum Biosciences (United States) pays non établi dans la noticeEntreprise
-
Harvard University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Meinig School of Biomedical Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Inc Kanvas Biosciences pays non établi dans la noticeEntreprise
-
Harvard School of Dental Medicine Department of Oral Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Cornell University, Signum Biosciences (United States) et Harvard University, avec 3 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.