Stemformatics data portal enables transcriptional benchmarking of lab-derived myeloid cells
Rattachement africain : au. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Stemformatics.org has been serving the stem cell research community for over a decade, by making it easy for users to find and view transcriptional profiles of pluripotent and adult stem cells and their progeny, comparing data derived from multiple tissues and derivation methods. In recent years, Stemformatics has shifted its focus from curation to collation and integration of public data with shared phenotypes. It now hosts several integrated expression atlases based on human myeloid cells, which allow for easy cross-dataset comparisons and discovery of emerging cell subsets and activation properties. The atlases are designed for external users to benchmark their own data against a common reference. Here, we use case studies to illustrate how to find and explore previously published datasets of relevance and how in-vitro-derived cells can be transcriptionally matched to cells in the integrated atlas to highlight phenotypes of interest.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Stemformatics data portal enables transcriptional benchmarking of lab-derived myeloid cells
- Date Crossref
- 01/06/2024
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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The University of Melbourne Melbourne Data Analytics Platform pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Florey Institute of Neuroscience and Mental Health pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Peter Doherty Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Faculty of Medicine Department of Anatomy and Physiology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Melbourne Data Analytics Platform — The University of Melbourne, Florey Institute of Neuroscience and Mental Health et Peter Doherty Institute, avec 1 autre affiliation.
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