Tagless LysoIP method for molecular profiling of lysosomal content in clinical samples
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Le résumé fourni par la source
Abstract Lysosomes are implicated in a wide spectrum of human diseases including monogenic lysosomal storage disorders (LSDs), age-associated neurodegeneration and cancer. Profiling lysosomal content using tag-based lysosomal immunoprecipitation (LysoTagIP) in cell and animal models allowed major discoveries in the field, however studying lysosomal dysfunction in human patients remains challenging. Here, we report the development of the “tagless LysoIP method” to enable rapid enrichment of lysosomes, via immunoprecipitation, using the endogenous integral lysosomal membrane protein TMEM192, directly from clinical samples and human cell lines (e.g. induced Pluripotent Stem Cell (iPSCs) derived neurons). Isolated lysosomes are intact and suitable for subsequent multimodal omics analyses. To validate our approach, we employed the tagless LysoIP to enrich lysosomes from peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) derived from fresh blood from patients with CLN3 disease, a neurodegenerative LSD. Metabolic profiling of isolated lysosomes showed massive accumulation of glycerophosphodiesters (GPDs) in patients’ lysosomes. Interestingly, a patient with a milder phenotype and genotype displayed lower accumulation of lysosomal GPDs, consistent with their potential role as disease biomarkers. Altogether, the tagless LysoIP provides a framework to study native lysosomes from patient samples, identify novel biomarkers and discover human-relevant disease mechanisms.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Tagless LysoIP method for molecular profiling of lysosomal content in clinical samples
- Date Crossref
- 19/05/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of Dundee pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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MRC Protein Phosphorylation and Ubiquitylation Unit pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Medical Research Council pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Stanford Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Stanford University Department of Chemical Engineering pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Universitätsklinikum Erlangen pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Utrecht University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Medical Center Utrecht Department of Metabolic Diseases pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Wilhelmina Children's Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Universität Hamburg pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Medical Center Hamburg-Eppendorf Department of Pediatrics pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
University of Dundee, MRC Protein Phosphorylation and Ubiquitylation Unit et Medical Research Council, avec 9 autres affiliations.
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