Jumbo phages possess independent synthesis and utilization systems of NAD +
Rattachement africain : cn, de, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Jumbo phages, phages with genomes >200 kbp, contain some unique genes for successful reproduction in their bacterial hosts. Due to complex and massive genomes analogous to those of small-celled bacteria, how do jumbo phages complete their life cycle remain largely undefined. In this study, we assembled 668 high-quality jumbo phage genomes from over 15 TB of intestinal metagenomic data from 955 samples of five animal species (cow, sheep, pig, horse, and deer). Within them, we obtained a complete genome of 716 kbp in length, which is the largest phage genome so far reported in the gut environments. Interestingly, 174 out of the 668 jumbo phages were found to encode all genes required for synthesis of NAD + by the salvage pathway or Preiss-Handler pathway, referred as NAD-jumbo phage. Besides synthesis genes of NAD + , these NAD-jumbo phages also encode at least 15 types of NAD + -consuming enzyme genes involved in DNA replication, DNA repair, and counterdefense, suggesting that these phages not only have the capacity to synthesize NAD + but also redirect NAD + metabolism towards phage propagation need in hosts. Phylogenetic analysis and environmental survey indicated NAD-jumbo phages are widely present in the Earth’s ecosystems, including the human gut, lakes, salt ponds, mine tailings, and seawater. In summary, this study expands our understanding of the diversity and survival strategies of phages, and in-depth study of the NAD-jumbo phages is crucial for understanding their role in ecological regulation.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- Jumbo phages possess independent synthesis and utilization systems of NAD <sup>+</sup>
- Date Crossref
- 19/04/2024
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
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Où se fait cette recherche
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Shihezi University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Shenzhen University Institute for Advanced Study pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Konstanz Department of Biology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Planetary Science Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of California Department of Earth and Planetary Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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College of Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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State Key Laboratory of Sheep Genetic Improvement and Healthy Production pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Shihezi University, Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science et Institute for Advanced Study — Shenzhen University, avec 5 autres affiliations.
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