Pervasive translation of Xrn1-sensitive unstable long non-coding RNAs in yeast
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Le résumé fourni par la source
Despite being predicted to lack coding potential, cytoplasmic long noncoding (lnc)RNAs can associate with ribosomes. However, the landscape and biological relevance of lncRNA translation remain poorly studied. In yeast, cytoplasmic Xrn1-sensitive unstable transcripts (XUTs) are targeted by nonsense-mediated mRNA decay (NMD), suggesting a translation-dependent degradation process. Here, we report that XUTs are pervasively translated, which impacts their decay. We show that XUTs globally accumulate upon translation elongation inhibition, but not when initial ribosome loading is impaired. Ribo-seq confirmed ribosomes binding to XUTs and identified ribosome-associated 5'-proximal small ORFs. Mechanistically, the NMD-sensitivity of XUTs mainly depends on the 3'-untranslated region length. Finally, we show that the peptide resulting from the translation of an NMD-sensitive XUT reporter exists in NMD-competent cells. Our work highlights the role of translation in the posttranscriptional metabolism of XUTs. We propose that XUT-derived peptides could be exposed to natural selection, while NMD restricts XUT levels.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Pervasive translation of Xrn1-sensitive unstable long non-coding RNAs in yeast
- Date Crossref
- 05/03/2024
- Éditeur
- Cold Spring Harbor Laboratory
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Sorbonne Université Institut Curie pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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