Tsetlin Machine in DNA sequence classification : Application to prokaryote gene prediction / A match made in silico
Rattachement africain : no. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The Tsetlin machine (TM) is a logic-based machine learning model with the crucial advantages of transparency and hardware-friendliness. In TM, groups of Tsetlin Automata (TAs) produce Boolean expressions in the form of conjunctive clauses in AND-rules. In this work, we show that the DNA nucleotide sequence, coded using the four-letter alphabet A, C, G, T, is a perfect match to the Boolean logic-based TM. A coalesced integer-weighted TM is applied to the problem of prokaryote gene prediction demonstrating beyond state-of-the-art performance on reference genomes. This paves the way for highly efficient bioinformatic analysis in a large range of applications.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Tsetlin Machine in DNA sequence classification : Application to prokaryote gene prediction / A match made in silico
- Date Crossref
- 29/08/2023
- Éditeur
- IEEE
- Type
- proceedings-article
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Où se fait cette recherche
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Norwegian University of Life Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Agder Centre for AI Research pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Norwegian University of Life Sciences et Centre for AI Research — University of Agder.
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