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Accès ouvert déclaré 2024 preprint

A conserved Pol II elongator SPT6L mediates Pol V transcription elongation to regulate RNA-directed DNA methylation in Arabidopsis

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9Institutions déclarées
2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : cn, ca. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract In plants, the plant-specific RNA polymerase V (Pol V) transcripts non-coding RNAs and provides a docking platform for the association of accessory proteins in the RNA-directed DNA methylation (RdDM) pathway. Various components have been uncovered that are involved in the process of DNA methylation, but it is still not clear how the transcription of Pol V is regulated. Here, we found that the conserved Pol II elongator, SPT6L, bound to thousands of intergenic regions in an RNA polymerase II (Pol II) independent manner. The intergenic enrichment of SPT6L, interestingly, co-occupied with the largest subunit of Pol V (NRPE1) and mutation of SPT6L led to the reduction of DNA methylation but not Pol V enrichment. Furthermore, the association of SPT6L at Pol V loci was dependent on the Pol V associated factor, SPT5L, rather than the presence of Pol V, and the interaction between SPT6L and NRPE1 was compromised in spt5l . Finally, Pol V RIP-seq revealed that SPT6L is required to maintain the amount and length of Pol V transcripts. Our findings thus uncovered the critical role of a Pol II conserved elongator in Pol V mediated DNA methylation and transcription, and shed light on the mutual regulation between Pol V and II in plants.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.

Titre Crossref
A conserved Pol II elongator SPT6L mediates Pol V transcription elongation to regulate RNA-directed DNA methylation in <i>Arabidopsis</i>
Date Crossref
09/01/2024
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • South China Botanical Garden pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • University of Chinese Academy of Sciences pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Guangdong Academy of Agricultural Sciences pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Lanzhou University pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Western University Department of Biology pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Agriculture and Agri-Food Canada pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • London Research and Development Centre pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Chinese Academy of Sciences pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Beijing Botanical Garden pays non établi dans la notice
    Institution
  • Key Laboratory of South China Agricultural Plant Molecular Analysis and Genetic Improvement & Guangdong Provincial Key Laboratory of Applied Botany pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • School of Life Sciences MOE Key Laboratory of Cell Activities and Stress Adaptations pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Key Laboratory of National Forestry and Grassland Administration on Plant Conservation and Utilization in Southern China pays non établi dans la notice
    Structure de recherche

South China Botanical Garden, University of Chinese Academy of Sciences et Guangdong Academy of Agricultural Sciences, avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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