Accès ouvert déclaré 2023 preprint

Chemical Tools for the Gid4 Subunit of the Human E3 Ligase C-terminal to LisH (CTLH) Degradation Complex

Aliakbar Khalili Yazdi, Sumera Perveen, Xiaosheng Song, Aiping Dong, Magdalena M. Szewczyk, Matthew F. Calabrese, Agustin Casimiro‐Garcia, Chakrapani Subramanyam, Matthew Dowling, Emel Ficici, Jisun Lee, Justin I. Montgomery, Thomas N. O’Connell, Grzegorz J. Skrzypek, Tuan P. Tran, Matthew D. Troutman, Feng Wang, Jennifer A. Young, Jinrong Min, Dalia Baršytė-Lovejoy, Peter J. Brown, Vijayaratnam Santhakumar, C.H. Arrowsmith, Masoud Vedadi, Dafydd R. Owen

7Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité

4Institutions déclarées

2Pays d’affiliation déclarés

Rattachement africain : ca, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

Abstract We have developed a novel chemical handle (PFI-E3H1) and a chemical probe (PFI-7) as ligands for the Gid4 subunit of the human E3 ligase CTLH degradation complex. Through an efficient initial hit-ID campaign, structure-based drug design (SBDD) and leveraging the sizeable Pfizer compound library, we identified a 500 nM ligand for this E3 ligase through file screening alone. Further exploration identified a vector that is tolerant to addition of a linker for future chimeric molecule design. The chemotype was subsequently optimized to sub-100 nM Gid4 binding affinity for a chemical probe. These novel tools, alongside the suitable negative control also identified, should enable the interrogation of this complex human E3 ligase macromolecular assembly.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Chemical Tools for the Gid4 Subunit of the Human E3 Ligase C-terminal to LisH (CTLH) Degradation Complex
Date Crossref: 14/11/2023
Éditeur: openRxiv
Type: posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

University of Toronto Structural Genomics Consortium pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Structural Genomics Consortium pays non établi dans la notice
Organisation à but non lucratif
Pfizer (United States) pays non établi dans la notice
Entreprise
Princess Margaret Cancer Centre pays non établi dans la notice
Établissement de santé
Pfizer Research & Development pays non établi dans la notice
Institution

Structural Genomics Consortium — University of Toronto, Structural Genomics Consortium et Pfizer (United States), avec 2 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Protein Degradation and InhibitorsUbiquitin and proteasome pathwaysPeptidase Inhibition and Analysis

Lire en accès ouvert Consulter la publication primaire Ouvrir le DOI