A fully sequenced collection of homozygous EMS mutants for forward and reverse genetic screens in Arabidopsis thaliana
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Le résumé fourni par la source
Abstract Genetic screens are powerful tools for biological research and are one of the reasons for the success of the thale cress Arabidopsis thaliana as a model species. Here, we describe the whole-genome sequencing of 871 Arabidopsis lines from the Homozygous EMS Mutant (HEM) collection as a novel resource for forward and reverse genetics. With an average 576 high-confidence mutations per HEM line, over three independent mutations altering protein sequence are found on average per gene in the collection. Pilot reverse genetics experiments on reproductive, developmental and physiological traits confirmed the efficacy of the tool for identifying both null and knockdown alleles. The possibility of conducting subtle repeated phenotyping of HEM lines and the immediate availability of the mutations will empower forward genetic approaches. The sequence resource is searchable with the ATHEM web interface ( https://lipm-browsers.toulouse.inra.fr/pub/ATHEM/ ), and the biological material is distributed by the Versailles Arabidopsis Stock Center.
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Le contrôle bibliographique ouvert
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- Titre Crossref
- A fully sequenced collection of homozygous EMS mutants for forward and reverse genetic screens in <i>Arabidopsis thaliana</i>
- Date Crossref
- 27/10/2023
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
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Où se fait cette recherche
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Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Université Fédérale de Toulouse Midi-Pyrénées pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut National de Recherche pour l'Agriculture pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Université de Toulouse LIPME pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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AgroParisTech pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Université Paris-Saclay pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Institut Jean-Pierre Bourgin pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Max Planck Institute for Plant Breeding Research Department of Chromosome Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
Centre National de la Recherche Scientifique, Université Fédérale de Toulouse Midi-Pyrénées et Institut National de Recherche pour l'Agriculture, avec 6 autres affiliations.
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