GenArk: towards a million UCSC genome browsers
Rattachement africain : us, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Interactive graphical genome browsers are essential tools in genomics, but they do not contain all the recent genome assemblies. We create Genome Archive (GenArk) collection of UCSC Genome Browsers from NCBI assemblies. Built on our established track hub system, this enables fast visualization of annotations. Assemblies come with gene models, repeat masks, BLAT, and in silico PCR. Users can add annotations via track hubs and custom tracks. We can bulk-import third-party resources, demonstrated with TOGA and Ensembl gene models for hundreds of assemblies.Three thousand two hundred sixty-nine GenArk assemblies are listed at https://hgdownload.soe.ucsc.edu/hubs/ and can be searched for on the Genome Browser gateway page.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- GenArk: towards a million UCSC genome browsers
- Date Crossref
- 02/10/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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University of California Genomics Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Goethe University Frankfurt pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Senckenberg Research Institute and Natural History Museum Frankfurt/M pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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LOEWE Centre for Translational Biodiversity Genomics pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Faculty of Biosciences Institute of Cell Biology and Neuroscience pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Genomics Institute — University of California, Goethe University Frankfurt et Senckenberg Research Institute and Natural History Museum Frankfurt/M, avec 2 autres affiliations.
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