Genome-wide Characterization of Diverse Bacteriophages Enabled by RNA-Binding CRISPRi
Rattachement africain : us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Bacteriophages constitute one of the largest sources of unknown gene content in the biosphere. Even for well-studied model phages, robust experimental approaches to identify and study their essential genes remain elusive. We uncover and exploit the conserved vulnerability of the phage transcriptome to facilitate genome-wide protein expression knockdown via programmable RNA-binding protein dRfxCas13d (CRISPRi-ART) across diverse phages and their host. Establishing the first broad-spectrum phage functional genomics platform, we predict over 90 essential genes across four phage genomes, a third of which have no known function. These results highlight hidden infection strategies encoded in the most abundant biological entities on earth and provide a facile platform to study them.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genome-wide Characterization of Diverse Bacteriophages Enabled by RNA-Binding CRISPRi
- Date Crossref
- 18/09/2023
- Éditeur
- openRxiv
- Type
- posted-content
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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QB3 pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Innovative Genomics Institute pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of California California Institute for Quantitative Biosciences (QB3) pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of California San Diego pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Gladstone Institutes pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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North Carolina State University Department of Food pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Lawrence Berkeley National Laboratory Environmental Genomics and Systems Biology Division pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Sandia National Laboratories California pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Howard Hughes Medical Institute pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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School of Biological Sciences pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Gladstone Institute of Data Science and Biotechnology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Systems Biology Department pays non établi dans la noticeInstitution
QB3, Innovative Genomics Institute et California Institute for Quantitative Biosciences (QB3) — University of California, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.