Accès ouvert déclaré
2023
article
Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis
Yize Li, Yongchao Dou, Felipe da Veiga Leprevost, Yifat Geffen, Anna Calinawan, François Aguet, Yo Akiyama, Shankara Anand, Chet Birger, Song Cao, Padmini Chilappagari, Marcin Cieślik, Antonio Colaprico, Daniel Cui Zhou, Corbin Day, Marcin J. Domagalski, Myvizhi Esai Selvan, David Fenyö, Steven M. Foltz, Alicia Francis, Tania J González-Robles, Zeynep H. Gümüş, David I. Heiman, Michael Holck, Runyu Hong, Yingwei Hu, Eric J. Jaehnig, Jiayi Ji, Wen Jiang, Lizabeth Katsnelson, Karen A. Ketchum, Robert J. Klein, Jonathan T. Lei, Wen-Wei Liang, Yuxing Liao, Caleb M. Lindgren, Weiping Ma, Lei Ma, Michael J. MacCoss, Fernanda Martins Rodrigues, Wilson McKerrow, Ngoc B. Nguyen, Robert Oldroyd, Alexander Pilozzi, Pietro Pugliese, Boris Reva, Paul A. Rudnick, Kelly V. Ruggles, Dmitry Rykunov, Sara R. Savage, Michael Schnaubelt, Tobias Schraink, Zhiao Shi, Deepak Singhal, Xiaoyu Song, Erik Storrs, Nadezhda V. Terekhanova, Ratna R. Thangudu, Mathangi Thiagarajan, Liang-Bo Wang, Joshua M. Wang, Ying Wang, Bo Wen, Yige Wu, Matthew A. Wyczalkowski, Xin Yi, Lijun Yao, Xinpei Yi, Hui Zhang, Qing Zhang, Maya Zuhl, Gad Getz, Li Ding, Alexey I. Nesvizhskii, Pei Wang, Ana I. Robles, Bing Zhang, Samuel Payne, Alexander J. Lazar, Amanda G. Paulovich, Antonio Iavarone, Arul M. Chinnaiyan, Brian Druker, Chandan Kumar‐Sinha, Chelsea J. Newton, Chen Huang, D.R. Mani, Richard Smith, Emily M. Huntsman, Eric E. Schadt, Eunkyung An, Francesca Petralia, Galen Hostetter, Gilbert S. Omenn, Hanbyul Cho, Henry Rodriguez, Iga Kołodziejczak, Jared L. Johnson, Jasmin Bavarva, Jimin Tan, Karin Rodland, Karl R. Clauser, Karsten Krug, Lewis C. Cantley, Maciej Wiznerowicz, Matthew J. Ellis, Meenakshi Anurag, Mehdi Mesri, Michael A. Gillette, Michael J. Birrer, Michele Ceccarelli, Saravana M. Dhanasekaran, Nathan Edwards, Nicole Tignor, Özgün Babur, Sara J.C. Gosline, Scott D. Jewell, Shankha Satpathy, Shrabanti Chowdhury, Stephan C. Schürer, Steven A. Carr, Tao Liu, Tara Hiltke, Tomer M. Yaron, Vasileios Stathias, Wenke Liu, Xu Zhang, Yizhe Song, Zhen Zhang, Daniel W. Chan
258Citations signalées, ce qui n’est pas une note de qualité
21Institutions déclarées
3Pays d’affiliation déclarés
Rattachement africain : us, it, my.
Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
The National Cancer Institute's Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium (CPTAC) investigates tumors from a proteogenomic perspective, creating rich multi-omics datasets connecting genomic aberrations to cancer phenotypes. To facilitate pan-cancer investigations, we have generated harmonized genomic, transcriptomic, proteomic, and clinical data for >1000 tumors in 10 cohorts to create a cohesive and powerful dataset for scientific discovery. We outline efforts by the CPTAC pan-cancer working group in data harmonization, data dissemination, and computational resources for aiding biological discoveries. We also discuss challenges for multi-omics data integration and analysis, specifically the unique challenges of working with both nucleotide sequencing and mass spectrometry proteomics data.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Proteogenomic data and resources for pan-cancer analysis
- Date Crossref
- 01/08/2023
- Éditeur
- Elsevier BV
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Les institutions déclarées
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.
Les sujets associés
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