Genetic and geographic influence on phenotypic variation in European sarcoidosis patients
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Le résumé fourni par la source
Introduction: Sarcoidosis is a highly variable disease in terms of organ involvement, type of onset and course. Associations of genetic polymorphisms with sarcoidosis phenotypes have been observed and suggest genetic signatures. Methods: After obtaining a positive vote of the competent ethics committee we genotyped 1909 patients of the deeply phenotyped Genetic-Phenotype Relationship in Sarcoidosis (GenPhenReSa) cohort of 31 European centers in 12 countries with 116 potentially disease-relevant single-nucleotide polymorphisms (SNPs). Using a meta-analysis, we investigated the association of relevant phenotypes (acute vs. sub-acute onset, phenotypes of organ involvement, specific organ involvements, and specific symptoms) with genetic markers. Subgroups were built on the basis of geographical, clinical and hospital provision considerations. Results: In the meta-analysis of the full cohort, there was no significant genetic association with any considered phenotype after correcting for multiple testing. In the largest sub-cohort (Serbia), we confirmed the known association of acute onset with TNF and reported a new association of acute onset an HLA polymorphism. Multi-locus models with sets of three SNPs in different genes showed strong associations with the acute onset phenotype in Serbia and Lublin (Poland) demonstrating potential region-specific genetic links with clinical features, including recently described phenotypes of organ involvement. Discussion: The observed associations between genetic variants and sarcoidosis phenotypes in subgroups suggest that gene-environment-interactions may influence the clinical phenotype. In addition, we show that two different sets of genetic variants are permissive for the same phenotype of acute disease only in two geographic subcohorts pointing to interactions of genetic signatures with different local environmental factors. Our results represent an important step towards understanding the genetic architecture of sarcoidosis.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Genetic and geographic influence on phenotypic variation in European sarcoidosis patients
- Date Crossref
- 09/08/2023
- Éditeur
- Frontiers Media SA
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Christian-Albrechts-Universität zu Kiel pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University Medical Center Freiburg pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Medizinische Hochschule Hannover pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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German Center for Lung Research pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Medical University of Lublin Department of Pneumonology pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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University of Siena pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Carol Davila University of Medicine and Pharmacy Department of Cardio-Thoracic Medicine pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Amsterdam UMC Location University of Amsterdam pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Churchill Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Oxford pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Research Center Borstel - Leibniz Lung Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Gdańsk Medical University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Christian-Albrechts-Universität zu Kiel, University Medical Center Freiburg et Medizinische Hochschule Hannover, avec 9 autres affiliations.
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