Proteomic profiling across breast cancer cell lines and models
Rattachement africain : us, fr, de. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
We performed quantitative proteomics on 60 human-derived breast cancer cell line models to a depth of ~13,000 proteins. The resulting high-throughput datasets were assessed for quality and reproducibility. We used the datasets to identify and characterize the subtypes of breast cancer and showed that they conform to known transcriptional subtypes, revealing that molecular subtypes are preserved even in under-sampled protein feature sets. All datasets are freely available as public resources on the LINCS portal. We anticipate that these datasets, either in isolation or in combination with complimentary measurements such as genomics, transcriptomics and phosphoproteomics, can be mined for the purpose of predicting drug response, informing cell line specific context in models of signalling pathways, and identifying markers of sensitivity or resistance to therapeutics.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Proteomic profiling across breast cancer cell lines and models
- Date Crossref
- 04/08/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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The University of Texas MD Anderson Cancer Center Department of Experimental Radiation Oncology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Harvard University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Center for Systems Biology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Institut de génétique et de biologie moléculaire et cellulaire pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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Bristol-Myers Squibb (Germany) pays non établi dans la noticeEntreprise
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Laboratory of Systems Pharmacology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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IGBMC pays non établi dans la noticeInstitution
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Inc. Department of Oncology Bioinformatics pays non établi dans la noticeEntreprise
Department of Experimental Radiation Oncology — The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Harvard University et Center for Systems Biology, avec 5 autres affiliations.
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