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Accès ouvert déclaré 2023 preprint

Multivalent GU-rich oligonucleotides sequester TDP-43 in the nucleus by inducing high molecular weight RNP complexes

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TDP-43 nuclear clearance and cytoplasmic aggregation are hallmarks of TDP-43 proteinopathies. We recently demonstrated that binding to endogenous nuclear GU-rich RNAs sequesters TDP-43 in the nucleus by restricting its passive nuclear export. Here, we tested the feasibility of synthetic RNA oligonucleotide-mediated augmentation of TDP-43 nuclear localization. Using biochemical assays, we compared the ability of GU-rich oligonucleotides to engage in multivalent, RRM-dependent binding with TDP-43. When transfected into cells, (GU)16 attenuated TDP-43 mislocalization induced by transcriptional blockade or RanGAP1 ablation. Clip34nt and (GU)16 accelerated TDP-43 nuclear re-import after cytoplasmic mislocalization. RNA pulldowns confirmed that multivalent GU-oligonucleotides induced high molecular weight RNP complexes, incorporating TDP-43 and possibly other GU-binding proteins. Transfected GU-repeat oligos disrupted TDP-43 cryptic exon repression, likely by diverting TDP-43 from endogenous RNAs, except for Clip34nt which contains interspersed A and C. Thus, exogenous multivalent GU-RNAs can promote TDP-43 nuclear localization, though pure GU-repeat motifs impair TDP-43 function.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
Multivalent GU-rich oligonucleotides sequester TDP-43 in the nucleus by inducing high molecular weight RNP complexes
Date Crossref
02/08/2023
Éditeur
openRxiv
Type
posted-content

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude et ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Institutions déclarées

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Sujets associés

RNA Research and SplicingNeurogenetic and Muscular Disorders ResearchRNA regulation and disease

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