Peptide conformational sampling using the Quantum Approximate Optimization Algorithm
Rattachement africain : gb, ch. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Abstract Protein folding has attracted considerable research effort in biochemistry in recent decades. In this work, we explore the potential of quantum computing to solve a simplified version of protein folding. More precisely, we numerically investigate the performance of the Quantum Approximate Optimization Algorithm (QAOA) in sampling low-energy conformations of short peptides. We start by benchmarking the algorithm on an even simpler problem: sampling self-avoiding walks. Motivated by promising results, we then apply the algorithm to a more complete version of protein folding, including a simplified physical potential. In this case, we find less promising results: deep quantum circuits are required to achieve accurate results, and the performance of QAOA can be matched by random sampling up to a small overhead. Overall, these results cast serious doubt on the ability of QAOA to address the protein folding problem in the near term, even in an extremely simplified setting.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Peptide conformational sampling using the Quantum Approximate Optimization Algorithm
- Date Crossref
- 17/07/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
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Phasecraft Ltd. (United Kingdom) pays non établi dans la noticeEntreprise
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University College London pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Roche (Switzerland) pays non établi dans la noticeEntreprise
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University of Bristol pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Monte Rosa Therapeutics AG pays non établi dans la noticeInstitution
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F. Hoffmann-La Roche Ltd. Roche Innovation Center Basel pays non établi dans la noticeEntreprise
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School of Mathematics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Phasecraft Ltd. (United Kingdom), University College London et Roche (Switzerland), avec 4 autres affiliations.
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