Einfluss des SEC62-Onkogens auf das Transkriptom und molekulare Pathways von Kopf-Hals-Tumoren

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Einleitung SEC62 gilt seit mehreren Jahren in verschiedenen Tumorentitäten als potentielles Onkogen und wird auch in ca. 86% aller Plattenepithelkarzinome des Kopf-Hals-Bereichs (HNSCC) überexprimiert. Die vollständige molekulare Funktion von SEC62, das am post-translationalen Proteintransport am ER beteiligt ist, ist noch nicht genau bekannt. Erste Studien konnten zeigen, dass eine SEC62-überexpression mit einem schlechteren Gesamtüberleben der Patienten sowie einer gesteigerten Metastasierung einhergeht. Um die molekulare Rolle von SEC62 besser verstehen und seinen Einfluss auf das Transkriptom von HNSCC-Zellen sowie deren molekulare Pathways untersuchen zu können, wurden zwei stabile SEC62-knockout Zelllinien mittels CRISPR-Cas9 generiert. Material und Methoden Mittels CRISPR-Cas9 wurden zwei stabile SEC62-ko Zelllinien aus FaDu Wildtyp-Zellen erzeugt und diese über eine RNA-Sequenzierung genauer analysiert und charakterisiert. Die bioinformatische Datenauswertung erfolgte mittels Perseus Software. Ergebnisse Eine differenzielle Genexpressionsanalyse zeigte, dass durch einen SEC62-ko in Summe 215 Gene in beiden Zelllinien signifikant reguliert werden, wobei sich hiervon 19 Gene in beiden ko-Zelllinien signifikant reguliert zeigen. Bei 4 gemeinsam regulierten Genen konnte eine signifikante Herunterregulation und bei 15 Genen eine signifikante Hochregulation nachgewiesen werden. Diskussion Unter den gemeinsam hochregulierten Genen zwischen beiden SEC62-ko Klonen befinden sich unter anderem mehrere potentielle Tumorsuppressor-Gene. Dies deutet auf einen Zusammenhang zwischen einem SEC62-ko und einer dadurch induzierten Verringerung der Metastasierungs- und Proliferationsfähigkeit dieser ko-Zellen hin was SEC62 zu einem attraktiven therapeutischen Target macht. EKFS, HOMFOR Exzellenz Publication History Article published online: 12 May 2023 Georg Thieme Verlag Rüdigerstraße 14, 70469 Stuttgart, Germany

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.