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Accès ouvert déclaré 2023 article

The compact genome of the sponge Oopsacas minuta (Hexactinellida) is lacking key metazoan core genes

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Rattachement africain : fr, re, ca, gb, es, us. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.

Le résumé fourni par la source

BACKGROUND: Explaining the emergence of the hallmarks of bilaterians is a central focus of evolutionary developmental biology-evodevo-and evolutionary genomics. For this purpose, we must both expand and also refine our knowledge of non-bilaterian genomes, especially by studying early branching animals, in particular those in the metazoan phylum Porifera. RESULTS: We present a comprehensive analysis of the first whole genome of a glass sponge, Oopsacas minuta, a member of the Hexactinellida. Studying this class of sponge is evolutionary relevant because it differs from the three other Porifera classes in terms of development, tissue organization, ecology, and physiology. Although O. minuta does not exhibit drastic body simplifications, its genome is among the smallest of animal genomes sequenced so far, and surprisingly lacks several metazoan core genes (including Wnt and several key transcription factors). Our study also provides the complete genome of a symbiotic Archaea dominating the associated microbial community: a new Thaumarchaeota species. CONCLUSIONS: The genome of the glass sponge O. minuta differs from all other available sponge genomes by its compactness and smaller number of encoded proteins. The unexpected loss of numerous genes previously considered ancestral and pivotal for metazoan morphogenetic processes most likely reflects the peculiar syncytial tissue organization in this group. Our work further documents the importance of convergence during animal evolution, with multiple convergent evolution of septate-like junctions, electrical-signaling and multiciliated cells in metazoans.

Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.

Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref
The compact genome of the sponge Oopsacas minuta (Hexactinellida) is lacking key metazoan core genes
Date Crossref
19/06/2023
Éditeur
Springer Science and Business Media LLC
Type
journal-article

Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.

Où se fait cette recherche

  • Centre National de la Recherche Scientifique pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Aix-Marseille Université pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Institut de Microbiologie de la Méditerranée pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Laboratoire Information Génomique et Structurale pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Délégation Paris 7 pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Université Paris Cité pays non établi dans la notice
    Université ou école supérieure
  • Sorbonne Paris Cité pays non établi dans la notice
    Institution
  • Institut Jacques Monod pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Institut Méditerranéen de Biodiversité et d'Ecologie Marine et Continentale pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Institut de Recherche pour le Développement pays non établi dans la notice
    Organisme public
  • Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement pays non établi dans la notice
    Structure de recherche
  • Agropolis International pays non établi dans la notice
    Institution

Centre National de la Recherche Scientifique, Aix-Marseille Université et Institut de Microbiologie de la Méditerranée, avec 9 autres affiliations.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

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