Accès ouvert déclaré
2023
article
Sequencing by avidity enables high accuracy with low reagent consumption
Sinan Arslan, Francisco J. Blanco García, Minghao Guo, Matthew W. Kellinger, Semyon Kruglyak, Jake A. LeVieux, Adeline Mah, Haosen Wang, Junhua Zhao, Chunhong Zhou, Andrew Altomare, J. Kevin Bailey, Matthew B. Byrne, Chiting Chang, Steve X. Chen, Byungrae Cho, Claudia N. Dennler, Vivian T. Dien, Derek Fuller, Ryan Kelley, Omid Khandan, Michael Klein, Michael Kim, Bryan R. Lajoie, Bill Lin, Yu Liu, Tyler Lopez, Peter T. Mains, Andrew Price, Samantha R. Robertson, Hermes Taylor‐Weiner, Ramreddy Tippana, Austin B. Tomaney, Su Zhang, Minna Abtahi, Mark R. Ambroso, Rosita Bajari, Ava M. Bellizzi, Chris B. Benitez, D. R. Bérard, Lorenzo Berti, Kelly Blease, Angela P. Blum, Andrew M. Boddicker, Leo Bondar, Chris Brown, Chris A. Bui, Juan Calleja-Aguirre, Kevin Cappa, Joshua Chan, Victor W.-C. Chang, Katherine Charov, Xiyi Chen, Rodger M. Constandse, Weston Damron, Mariam Dawood, Nicole DeBuono, John D. Dimalanta, Laure Edoli, Keerthana Elango, Nikka Faustino, Chao Feng, Matthew J. Ferrari, Keith Frankie, Adam Fries, Anne Galloway, Vlad Gavrila, Gregory J. Gemmen, James Ghadiali, Arash Ghorbani, Logan A. Goddard, Adriana Roginski Guetter, Garren L. Hendricks, Jendrik Hentschel, Daniel J. Honigfort, Yun-Ting Hsieh, Yu-Hsien Hwang Fu, Scott Im, Chaoyi Jin, Shradha Kabu, Daniel E. Kincade, Shawn Levy, Yu Li, Vincent Liang, William H. Light, Jonathan B. Lipsher, Tsung-li Liu, Grace Long, Rui Ma, John M. Mailloux, Kyle A. Mandla, Anyssa R. Martinez, Max Mass, Daniel T. McKean, Michael Meron, E. Miller, Celyne S. Moh, Rachel Moore, Juan Moreno, Jordan M. Neysmith, Cassandra S. Niman, Jesus M. Nunez, Micah Ojeda, Sara Espinosa Ortiz, Jenna Owens, Geoffrey B. Piland, Daniel J. Proctor, Josua Purba, Michael Ray, Daisong Rong, Virginia M. Saade, Sanchari Saha, Gustav Santo Tomas, Nicholas Scheidler, Luqmanal H. Sirajudeen, Samantha J. Snow, Gudrun Stengel, Ryan Stinson, Michael J. Stone, Keoni J. Sundseth, Eileen Thai, Connor Thompson, Marco Tjioe, Christy L. Trejo, Greg W. Trieger, Diane Ni Truong, Ben Tse, Benjamin Voiles, Henry Vuong, Jennifer C. Wong, Chiung-Ting Wu, Hua Yu, Yingxian Estella Yu, Ming Yu, Xi Zhang, Zhao Da, Genhua Zheng, Molly M. He, Michael J. R. Previte
85Citations signalées — pas une note de qualité
2Institutions déclarées
1Pays d’affiliation déclarés
Résumé fourni par la source
We present avidity sequencing, a sequencing chemistry that separately optimizes the processes of stepping along a DNA template and that of identifying each nucleotide within the template. Nucleotide identification uses multivalent nucleotide ligands on dye-labeled cores to form polymerase-polymer-nucleotide complexes bound to clonal copies of DNA targets. These polymer-nucleotide substrates, termed avidites, decrease the required concentration of reporting nucleotides from micromolar to nanomolar and yield negligible dissociation rates. Avidity sequencing achieves high accuracy, with 96.2% and 85.4% of base calls having an average of one error per 1,000 and 10,000 base pairs, respectively. We show that the average error rate of avidity sequencing remained stable following a long homopolymer.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- Sequencing by avidity enables high accuracy with low reagent consumption
- Date Crossref
- 25/05/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude et ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Institutions déclarées
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.
Sujets associés
Genomics and Phylogenetic StudiesRNA and protein synthesis mechanismsAdvanced biosensing and bioanalysis techniques