APOBEC mutagenesis is a common process in normal human small intestine
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Le résumé fourni par la source
APOBEC mutational signatures SBS2 and SBS13 are common in many human cancer types. However, there is an incomplete understanding of its stimulus, when it occurs in the progression from normal to cancer cell and the APOBEC enzymes responsible. Here we whole-genome sequenced 342 microdissected normal epithelial crypts from the small intestines of 39 individuals and found that SBS2/SBS13 mutations were present in 17% of crypts, more frequent than most other normal tissues. Crypts with SBS2/SBS13 often had immediate crypt neighbors without SBS2/SBS13, suggesting that the underlying cause of SBS2/SBS13 is cell-intrinsic. APOBEC mutagenesis occurred in an episodic manner throughout the human lifespan, including in young children. APOBEC1 mRNA levels were very high in the small intestine epithelium, but low in the large intestine epithelium and other tissues. The results suggest that the high levels of SBS2/SBS13 in the small intestine are collateral damage from APOBEC1 fulfilling its physiological function of editing APOB mRNA.
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Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.
- Titre Crossref
- APOBEC mutagenesis is a common process in normal human small intestine
- Date Crossref
- 26/01/2023
- Éditeur
- Springer Science and Business Media LLC
- Type
- journal-article
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Où se fait cette recherche
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Wellcome Sanger Institute Ageing and Somatic Mutation pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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University of Cambridge Department of Paediatrics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Broad Institute pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
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Cambridge University Hospitals NHS Foundation Trust Department of Pathology pays non établi dans la noticeOrganisme public
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University of Helsinki pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Addenbrooke's Hospital Department of Paediatric Gastroenterology pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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Norfolk and Norwich University Hospital pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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NIHR Research Delivery Network pays non établi dans la noticeOrganisme public
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Cancer Research UK Cambridge Center pays non établi dans la noticeStructure de recherche
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University of East Anglia Norwich Medical School pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
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Nuffield Orthopaedic Centre pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
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University of Oxford Medical Sciences Division pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
Ageing and Somatic Mutation — Wellcome Sanger Institute, Department of Paediatrics — University of Cambridge et Broad Institute, avec 9 autres affiliations.
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