CHD8 suppression impacts on histone H3 lysine 36 trimethylation and alters RNA alternative splicing
Rattachement africain : it, us, ca, gb. Niveau de preuve : code pays fourni par la source.
Le résumé fourni par la source
Disruptive mutations in the chromodomain helicase DNA-binding protein 8 gene (CHD8) have been recurrently associated with autism spectrum disorders (ASDs). Here we investigated how chromatin reacts to CHD8 suppression by analyzing a panel of histone modifications in induced pluripotent stem cell-derived neural progenitors. CHD8 suppression led to significant reduction (47.82%) in histone H3K36me3 peaks at gene bodies, particularly impacting on transcriptional elongation chromatin states. H3K36me3 reduction specifically affects highly expressed, CHD8-bound genes and correlates with altered alternative splicing patterns of 462 genes implicated in 'regulation of RNA splicing' and 'mRNA catabolic process'. Mass spectrometry analysis uncovered a novel interaction between CHD8 and the splicing regulator heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L (hnRNPL), providing the first mechanistic insights to explain the CHD8 suppression-derived splicing phenotype, partly implicating SETD2, a H3K36me3 methyltransferase. In summary, our results point toward broad molecular consequences of CHD8 suppression, entailing altered histone deposition/maintenance and RNA processing regulation as important regulatory processes in ASD.
Ce résumé expose les affirmations des auteurs. BNTIC ne l’interprète pas comme une validation indépendante des résultats.
Le contrôle bibliographique ouvert
DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé, mais le titre doit être comparé manuellement.
- Titre Crossref
- <i>CHD8</i> suppression impacts on histone H3 lysine 36 trimethylation and alters RNA alternative splicing
- Date Crossref
- 09/12/2022
- Éditeur
- Oxford University Press (OUP)
- Type
- journal-article
Ce recoupement confirme des métadonnées liées au DOI. Il ne confirme ni la méthode ni les conclusions de l’étude, et il ne compte pas comme une seconde source scientifique indépendante.
Où se fait cette recherche
-
University of Trento NeuroEpigenetics laboratory pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Broad Institute Program in Medical and Population Genetics pays non établi dans la noticeOrganisation à but non lucratif
-
Massachusetts General Hospital Center for Genomic Medicine pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
IFOM pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Hospital of Prato Bioinformatics Unit pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
University of Toronto Department of Molecular Genetics pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Hospital for Sick Children Genetics & Genome Biology Program pays non établi dans la noticeÉtablissement de santé
-
King's College London Centre for Craniofacial and Regenerative Biology and MRC Centre for Neurodevelopmental Disorders pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
MRC Centre for Neurodevelopmental Disorders pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Harvard University pays non établi dans la noticeUniversité ou école supérieure
-
Italian Institute of Technology pays non établi dans la noticeStructure de recherche
-
Istituto di Genetica Molecolare pays non établi dans la noticeStructure de recherche
NeuroEpigenetics laboratory — University of Trento, Program in Medical and Population Genetics — Broad Institute et Center for Genomic Medicine — Massachusetts General Hospital, avec 9 autres affiliations.
Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.