Accès ouvert déclaré 2022 article

Biallelic variants in coenzyme Q10 biosynthesis pathway genes cause a retinitis pigmentosa phenotype

Neringa Jurkutė, Francesca Cancellieri, Lisa Pohl, Catherina H. Z. Li, Robert A. Heaton, Janine Reurink, James Bellingham, Mathieu Quinodoz, Georgia Yioti, Maria I. Stefaniotou, Marianna E. Weener, Theresia Zuleger, Tobias B. Haack, Katarína Štingl, John C. Ambrose, Prabhu Arumugam, Roel P. J. Bevers, Marta Bleda, Christopher R. Boustred, Helen K. Brittain, Melissa A. Brown, Mark J. Caulfield, G. C. Chan, Adam P Giess, John N. Griffin, Angela D. Hamblin, Shirley J. Henderson, Tim Hubbard, Rachel L. Jackson, J. Louise Jones, Dalia Kasperavičiūtė, Melis Kayikci, Athanasios Kousathanas, Lea Lahnstein, Ashanté Lakey, Sarah E. A. Leigh, Ivone Un San Leong, Fabrice Lopez, Fiona Maleady-Crowe, Meriel McEntagart, Federico Minneci, J. Mitchell, Loukas Moutsianas, Marcus M. Mueller, Nirupa Murugaesu, Anna C. Need, Peter O’Donovan, Chris A. Odhams, Christine Patch, D. Perez-Gil, Mariana Buongermino Pereira, John Pullinger, Tahrima Rahim, Álvaro Rendón, TL Rogers, K. Savage, Kamlesh Sawant, Richard H. Scott, Afshan Siddiq, Alexander Sieghart, Samuel C. L. Smith, Alona Sosinsky, Alexander Stuckey, M. Tanguy, Ana Lisa Taylor Tavares, Ellen Thomas, Simon R. Thompson, Arianna Tucci, Matthew J. Welland, Eleanor M. Williams, Katarzyna J. Witkowska, Suzanne M. Wood, Magdalena Zarowiecki, Carel B. Hoyng, Omar A. Mahroo, Iain Parry Hargreaves, F. Lucy Raymond, Michel Michaelides, Carlo Rivolta, Susanne Kohl, Susanne Roosing, Andrew R. Webster, Gavin Arno

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Le résumé fourni par la source

Abstract The aim of this study was to investigate coenzyme Q10 (CoQ10) biosynthesis pathway defects in inherited retinal dystrophy. Individuals affected by inherited retinal dystrophy (IRD) underwent exome or genome sequencing for molecular diagnosis of their condition. Following negative IRD gene panel analysis, patients carrying biallelic variants in CoQ10 biosynthesis pathway genes were identified. Clinical data were collected from the medical records. Haplotypes harbouring the same missense variant were characterised from family genome sequencing (GS) data and direct Sanger sequencing. Candidate splice variants were characterised using Oxford Nanopore Technologies single molecule sequencing. The CoQ10 status of the human plasma was determined in some of the study patients. 13 individuals from 12 unrelated families harboured candidate pathogenic genotypes in the genes: PDSS1, COQ2, COQ4 and COQ5. The PDSS1 variant c.589 A > G was identified in three affected individuals from three unrelated families on a possible ancestral haplotype. Three variants (PDSS1 c.468-25 A > G, PDSS1 c.722-2 A > G, COQ5 c.682-7 T > G) were shown to lead to cryptic splicing. 6 affected individuals were diagnosed with non-syndromic retinitis pigmentosa and 7 had additional clinical findings. This study provides evidence of CoQ10 biosynthesis pathway gene defects leading to non-syndromic retinitis pigmentosa in some cases. Intronic variants outside of the canonical splice-sites represent an important cause of disease. RT-PCR nanopore sequencing is effective in characterising these splice defects.

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Le contrôle bibliographique ouvert

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Titre Crossref: Biallelic variants in coenzyme Q10 biosynthesis pathway genes cause a retinitis pigmentosa phenotype
Date Crossref: 20/10/2022
Éditeur: Springer Science and Business Media LLC
Type: journal-article

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