Accès ouvert déclaré 2022 article

Integrated multi-omics approach revealed cellular senescence landscape

Yuli Hou, Yiyin Zhang, Jing Liu, Yaqi Wang, Jingxuan Fu, Chi Zhang, Min Cao, Yuting Cui, Xiaomin Zhang, Xiaoling Wang, Jingjing Zhang, Congcong Liu, Yingzhen N. Zhang, Peichang Wang

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Le résumé fourni par la source

Cellular senescence is a complex multifactorial biological phenomenon that plays essential roles in aging, and aging-related diseases. During this process, the senescent cells undergo gene expression altering and chromatin structure remodeling. However, studies on the epigenetic landscape of senescence using integrated multi-omics approaches are limited. In this research, we performed ATAC-seq, RNA-seq and ChIP-seq on different senescent types to reveal the landscape of senescence and identify the prime regulatory elements. We also obtained 34 key genes and deduced that NAT1, PBX1 and RRM2, which interacted with each other, could be the potential markers of aging and aging-related diseases. In summary, our work provides the landscape to study accessibility dynamics and transcriptional regulations in cellular senescence. The application of this technique in different types of senescence allows us to identify the regulatory elements responsible for the substantial regulation of transcription, providing the insights into molecular mechanisms of senescence.

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Le contrôle bibliographique ouvert

DOI retrouvé dans Crossref DOI retrouvé ; titre concordant.

Titre Crossref: Integrated multi-omics approach revealed cellular senescence landscape
Date Crossref: 16/10/2022
Éditeur: Oxford University Press (OUP)
Type: journal-article

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Où se fait cette recherche

Capital Medical University Department of Clinical laboratory pays non établi dans la notice
Université ou école supérieure
Beijing Chuiyangliu Hospital pays non établi dans la notice
Établissement de santé
Shanghai Jiayin Biotechnology pays non établi dans la notice
Institution
Department of Clinical Laboratory pays non établi dans la notice
Structure de recherche

Department of Clinical laboratory — Capital Medical University, Beijing Chuiyangliu Hospital et Shanghai Jiayin Biotechnology, avec 1 autre affiliation.

Une affiliation ne permet pas de déduire la nationalité d’un auteur.

Les sujets associés

Single-cell and spatial transcriptomicsTelomeres, Telomerase, and SenescenceGenomics and Chromatin Dynamics

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